.
├── 7407_contr
│   ├── 7407_contr_L1_1.fq.gz
│   ├── 7407_contr_L1_2.fq.gz
│   ├── 7407_contr.L1.base.png
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├── 7407_treated
│   ├── 7407_treated_L1_1.fq.gz
│   ├── 7407_treated_L1_2.fq.gz
│   ├── 7407_treated.L1.base.png
│   └── 7407_treated.L1.qual.png
├── BGI_F22FTSEUHT2056_MUSpaxtR_en.pdf
├── CapH2_aux_R1
│   ├── CapH2_aux_R1_L1_1.fq.gz
│   ├── CapH2_aux_R1_L1_2.fq.gz
│   ├── CapH2_aux_R1.L1.base.png
│   └── CapH2_aux_R1.L1.qual.png
├── CapH2_aux_R2
│   ├── CapH2_aux_R2_L1_1.fq.gz
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│   ├── CapH2_aux_R2.L1.base.png
│   └── CapH2_aux_R2.L1.qual.png
├── CapH2_C_R1
│   ├── CapH2_C_R1_L1_1.fq.gz
│   ├── CapH2_C_R1_L1_2.fq.gz
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├── CapH2_C_R2
│   ├── CapH2_C_R2_L1_1.fq.gz
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│   ├── CapH2_C_R2.L1.base.png
│   └── CapH2_C_R2.L1.qual.png
├── CapH_aux_R1
│   ├── CapH_aux_R1_L1_1.fq.gz
│   ├── CapH_aux_R1_L1_2.fq.gz
│   ├── CapH_aux_R1.L1.base.png
│   └── CapH_aux_R1.L1.qual.png
├── CapH_aux_R2
│   ├── CapH_aux_R2_L1_1.fq.gz
│   ├── CapH_aux_R2_L1_2.fq.gz
│   ├── CapH_aux_R2.L1.base.png
│   └── CapH_aux_R2.L1.qual.png
├── CapH_C_R1
│   ├── CapH_C_R1_L1_1.fq.gz
│   ├── CapH_C_R1_L1_2.fq.gz
│   ├── CapH_C_R1.L1.base.png
│   └── CapH_C_R1.L1.qual.png
├── CapH_C_R2
│   ├── CapH_C_R2_L1_1.fq.gz
│   ├── CapH_C_R2_L1_2.fq.gz
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├── Clover_1w
│   ├── Clover_1w_L1_1.fq.gz
│   ├── Clover_1w_L1_2.fq.gz
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├── Clover_2w
│   ├── Clover_2w_L1_1.fq.gz
│   ├── Clover_2w_L1_2.fq.gz
│   ├── Clover_2w.L1.base.png
│   └── Clover_2w.L1.qual.png
├── Clover_ctr
│   ├── Clover_ctr_L1_1.fq.gz
│   ├── Clover_ctr_L1_2.fq.gz
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│   └── Clover_ctr.L1.qual.png
├── F22FTSEUHT2056_MUSpaxtR.readme.txt
├── kit30plus-CTCF-rep1
│   ├── kit30plus-CTCF-rep1_L1_1.fq.gz
│   ├── kit30plus-CTCF-rep1_L1_2.fq.gz
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├── kit30plus-CTCF-rep2
├── kit30plus-input-rep1
│   ├── kit30plus-input-rep1_L1_1.fq.gz
│   ├── kit30plus-input-rep1_L1_2.fq.gz
│   ├── kit30plus-input-rep1.L1.base.png
│   └── kit30plus-input-rep1.L1.qual.png
├── kit30plus-input-rep2
│   ├── kit30plus-input-rep2_L1_1.fq.gz
│   ├── kit30plus-input-rep2_L1_2.fq.gz
│   ├── kit30plus-input-rep2.L1.base.png
│   └── kit30plus-input-rep2.L1.qual.png
├── md5.txt
├── ProductionTable.xls
├── Red_1w
│   ├── Red_1w_L1_1.fq.gz
│   ├── Red_1w_L1_2.fq.gz
│   ├── Red_1w.L1.base.png
│   └── Red_1w.L1.qual.png
├── Red_2w
│   ├── Red_2w_L1_1.fq.gz
│   ├── Red_2w_L1_2.fq.gz
│   ├── Red_2w.L1.base.png
│   └── Red_2w.L1.qual.png
├── Red_ctr
│   ├── Red_ctr_L1_1.fq.gz
│   ├── Red_ctr_L1_2.fq.gz
│   ├── Red_ctr.L1.base.png
│   └── Red_ctr.L1.qual.png
├── U87
│   ├── U87_L1_1.fq.gz
│   ├── U87_L1_2.fq.gz
│   ├── U87.L1.base.png
│   └── U87.L1.qual.png
├── undetermine.out1.fq.gz 
└── undetermine.out2.fq.gz 

21 directories, 86 files