FastQCFastQC Report
Fri 21 Oct 2022
sample.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filenamesample.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences226
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length62-151
%GC33

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA9441.5929203539823No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTTT135.752212389380531No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCGTATGGTAC125.3097345132743365No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGCATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTTT62.6548672566371683No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTCGGAAGTTTACAT62.6548672566371683No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAATTGGAGCAGGTGATAAGCTG62.6548672566371683No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATATTAAAATTGTACA41.7699115044247788No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTCTAAAATT41.7699115044247788No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTGAAGTCGGAAGTTTACATACACT41.7699115044247788No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGCCTGCTGCTGTTTTACA31.3274336283185841No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTTTAACATCCAAA31.3274336283185841No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGAA31.3274336283185841No Hit
ATGTCAGGAATTTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT31.3274336283185841No Hit
ATGTCAGGAATGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT20.8849557522123894No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCGTATGGTACA20.8849557522123894No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTATAGAAGTATATT20.8849557522123894No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT20.8849557522123894No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGGATTATAGAAGTATATT20.8849557522123894No Hit
ATTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGCCTGCTGCTGTTTTACG10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAGGGTGTAT10.4424778761061947No Hit
ATGTCGGAATTGGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGAAGTC10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGAATGTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTATGT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGAATTTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTATG10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTT10.4424778761061947No Hit
ATGGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGCGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGGATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
AATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAAAATAA10.4424778761061947No Hit
ATGGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAATTGGAGTCATTAAAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGATAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGAGAAG10.4424778761061947No Hit
ATGTCGGAATTGAGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAATGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAAAATAA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGGATAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCGTATGGTACA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGCTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTCTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAATTGTATTTGGCTAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAGAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT10.4424778761061947No Hit
ACGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTGAAGTCGGAAGTCTACATACACT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTAGAGTCATTAAAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGATTGTGAAAAAGTGAGTTGAAGTCGGAAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTGAAGTCGGAAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGCATTAAAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATATTAAAATTGTACAG10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGAATA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTATGTGTTAATCTG10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTGAAGTCGGAAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAACTGTTT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAGAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCCAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGAGAGTTTAAATGCCTGCTGCTGTTTTACA10.4424778761061947No Hit
TGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGATTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCGTATGGTACA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTCTAAAATTC10.4424778761061947No Hit
ATTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAAAATAAC10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGCGAA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGATAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGATTTGTAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAGTGTATTTGGCTAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTTT10.4424778761061947No Hit
ATTCAGGAATTGTGAATAAGTGAGTTTAATTGTTTTTGGCTAAGGTGTAT10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCGTATGGTACAG10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGAGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTGAGGTGTA10.4424778761061947No Hit
ATGTCAGGAATGTAAAAAGTGAGTTTAAATGTATATTAAAATTGTACAGA10.4424778761061947No Hit
ATGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG10.4424778761061947No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

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