FastQCFastQC Report
Wed 13 Oct 2021
cutIL_50_S50_L001_R1_001.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenamecutIL_50_S50_L001_R1_001.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences19177
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length50-151
%GC34

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA1200562.601032486833184No Hit
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ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTAACCAATATTCTAACT4442.315273504719195No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT4342.2631277050633574No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAACATTTG3391.7677426083328989No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAACGTAACCAATATTCTAACT2491.2984304114303593No Hit
ATGTCAGGAATGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT2311.2045679720498514No Hit
ATGTCAGGATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT1660.8656202742869061No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGGGAAAGAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTTT1340.6987537153882254No Hit
ATGTAAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA1170.6101058559733014No Hit
ATGTCAGGAATTTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT1080.5631746362830474No Hit
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ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTTAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA870.4536684570057882No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAACGTATTTGGCTAAGGTGTA840.4380247171090369No Hit
ATGTCAGGAATTGGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT800.41716639724670174No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGGGAAAGAAAGTTGGAGTCATTAAAACTCGTTT770.4015226573499505No Hit
ATGTCAGGAATTGTAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT670.3493768576941127No Hit
ATGTCAGTAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA660.344162277728529No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCCAAGGTGTA620.32330395786619387No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGCGTA600.31287479793502637No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAACATCTG530.27637273817593994No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTATATGTATTTGGCTAAGGTGTA510.2659435782447724No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTTGCTAAGGTGTA480.25029983834802105No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTG470.24508525838243728No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGCTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA460.23987067841685353No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTACTTGGCTAAGGTGTA450.23465609845126975No Hit
ATGTTAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA440.22944151848568595No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAGATGTATTTGGCTAAGGTGTA420.21901235855451845No Hit
ATGGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGT400.20858319862335087No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTATGGTGTA390.20336861865776712No Hit
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ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAATGTGTA370.19293945872659957No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAGTGTATTTGGCTAAGGTGTA370.19293945872659957No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTCTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA360.18772487876101582No Hit
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ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAGGGTGTA340.17729571882984826No Hit
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ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTGTTTGGCTAAGGTGTA320.1668665588986807No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTATA300.15643739896751319No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTGAGGTGTA290.15122281900192938No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGCATTTGGCTAAGGTGTA260.13557907910517808No Hit
ATGTCGGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA240.12514991917401053No Hit
ATGCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT240.12514991917401053No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGGGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA230.11993533920842676No Hit
ATGTCGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT220.11472075924284297No Hit
ATGTCATGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA220.11472075924284297No Hit
ATGCCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA220.11472075924284297No Hit
ATGTAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT210.10950617927725922No Hit
ATTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT200.10429159931167543No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTAACCAATATTCTATCT200.10429159931167543No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGATAAGGTGTA200.10429159931167543No Hit
AGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT200.10429159931167543No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTAGCTAAGGTGTA200.10429159931167543No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

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