FastQCFastQC Report
Tue 12 Oct 2021
G1_R1_merge.fq

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameG1_R1_merge.fq
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences54365
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151-251
%GC38

[FAIL]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA3249759.7755909132714No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTNTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA674612.40871884484503No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT11272.0730249241239767No Hit
ATGTCAGGAATGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT5591.028235077715442No Hit
ATTTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA4850.892118090683344No Hit
ATGTCAGGATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT4660.857169134553481No Hit
ATATCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA4470.8222201784236182No Hit
ATGTCAGGAATTTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT2930.5389496918973604No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAGTGAGTTNAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT2550.4690517796376345No Hit
ATGTAAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA2500.4598546859192495No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTTAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA2200.4046721236089396No Hit
ATGTCAGGAATTGTAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT2160.3973144486342316No Hit
ATGTCAGGAATTGTTAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA2110.3881173549158466No Hit
ATGTCAGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT2020.3715625862227536No Hit
ATGTCAGGAATTGGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT1870.34397130506759865No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGCGTA1750.32189828014347466No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATCTGGCTAAGGTGTA1610.2961464177319967No Hit
ATGTTAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA1610.2961464177319967No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTATATGTATTTGGCTAAGGTGTA1530.2814310677825807No Hit
ATGTCAGTAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA1440.26487629908948773No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTCTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA1260.23176676170330174No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAGGGTGTA1250.22992734295962475No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTTGCTAAGGTGTA1210.22256966798491676No Hit
ATGTCAGGAATGTGAAAAAGTGAGTTNAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT1210.22256966798491676No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAACGTATTTGGCTAAGGTGTA1200.22073024924123977No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAGATGTATTTGGCTAAGGTGTA1200.22073024924123977No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTACTTGGCTAAGGTGTA1190.2188908304975628No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTCGGCTAAGGTGTA1170.2152119930102088No Hit
ATCTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA1120.2060148992918238No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGCA1110.20417548054814677No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAGTGTATTTGGCTAAGGTGTA1080.1986572243171158No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGCTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA1020.1876207118550538No Hit
ATGTCAGGATTGTGAAAAAGTGAGTTNAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT980.1802630368803458No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCCAAGGTGTA970.17842361813666882No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTG910.16738710567460682No Hit
ATGGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGT910.16738710567460682No Hit
ATGTCATGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA890.16370826818725281No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGT840.15451117446886783No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAATGTGTA830.15267175572519084No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGATAAGGTGTA810.14899291823783684No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTGAGGTGTA800.14715349949415985No Hit
ATGTAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT760.13979582451945186No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGCATTTGGCTAAGGTGTA730.13427756828842086No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGGGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA690.12691989331371287No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTAGCTAAGGTGTA690.12691989331371287No Hit
ATGCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT660.12140163708268187No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTGAATGTATTTGGCTAAGGTGTA660.12140163708268187No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTACATACACTTAAGTTGGAGTCA640.11772279959532787No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTGTTTGGCTAAGGTGTA640.11772279959532787No Hit
ATGCCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA630.11588338085165087No Hit
ATTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT620.11404396210797389No Hit
TGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT590.10852570587694288No Hit
ATGTCAGGAATTTGAAAAAGTGAGTTNAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT590.10852570587694288No Hit
ATGTCGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT580.10668628713326589No Hit
ATGTCAGGAATTGCGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA560.1030074496459119No Hit
ATGTCAGGAATTGTAAAAAGTGAGTTNAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT550.1011680309022349No Hit
ATGTCAGGAACTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA550.1011680309022349No Hit

[FAIL]Adapter Content

Adapter graph

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