FastQCFastQC Report
Tue 28 Dec 2021
cir-15w-d4_S60_L003_R1_001.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
Filenamecir-15w-d4_S60_L003_R1_001.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences29480
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length151
%GC36

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per base quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA2219275.27815468113975No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT7512.5474898236092267No Hit
ATGTCAGGATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT3681.248303934871099No Hit
ATGTCAGGAATGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT3591.217774762550882No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTATGAGACA2030.6886024423337856No Hit
ATGTCAGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT1830.6207598371777476No Hit
ATGTCAGGAATTTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT1760.5970149253731344No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAATGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT1470.4986431478968792No Hit
ATGTCAGGAATTGTAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT1390.471506105834464No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAACGTATTTGGCTAAGGTGTA1360.46132971506105835No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAGGGTGTA1290.437584803256445No Hit
ATGTCAGGAATTGGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT1260.42740841248303935No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGCGTA1230.4172320217096337No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATCTGGCTAAGGTGTA1210.4104477611940298No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTACTTGGCTAAGGTGTA1120.37991858887381275No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAGTGTATTTGGCTAAGGTGTA1090.3697421981004071No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGCTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA1060.3595658073270014No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTCGGCTAAGGTGTA1050.35617367706919945No Hit
ATGTTAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA890.301899592944369No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGGGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA870.29511533242876525No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAGATGTATTTGGCTAAGGTGTA840.2849389416553596No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTCTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA820.2781546811397558No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTG660.22388059701492538No Hit
ATTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT610.20691994572591588No Hit
ATGTAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT610.20691994572591588No Hit
ATGGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGT610.20691994572591588No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGCATTTGGCTAAGGTGTA580.19674355495251017No Hit
AGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT570.19335142469470826No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTGAGGTGTA550.18656716417910446No Hit
ACGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA530.1797829036635007No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCCAAGGTGTA510.1729986431478969No Hit
ATGCCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA510.1729986431478969No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGT490.16621438263229307No Hit
ATGCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT480.16282225237449116No Hit
ATGTCAGGAATTGCGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA480.16282225237449116No Hit
TGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT470.15943012211668928No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTGTTTGGCTAAGGTGTA460.15603799185888736No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGCA450.15264586160108548No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTAGGCTAAGGTGTA440.1492537313432836No Hit
ATGTCGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTAT410.1390773405698779No Hit
ATGTCAGGAATGTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTATG400.13568521031207598No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTGAATGTATTTGGCTAAGGTGTA390.13229308005427406No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTCAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA380.12890094979647218No Hit
ATGTCAGGAATTGTGGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGT350.11872455902306649No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGATGTA340.11533242876526459No Hit
GTGTCAGGAATTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA330.11194029850746269No Hit
ATGTCAGGAACTGTGAAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA330.11194029850746269No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAAAAGCGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA300.10176390773405698No Hit
ATGTCAGGATTGTGAAAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTATG300.10176390773405698No Hit
ATGTCAGGAATTGTGAAGAAGTGAGTTTAAATGTATTTGGCTAAGGTGTA300.10176390773405698No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

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