CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2984 136930 2.13 139914 2 1155 79984 1.42 81139 3 1510 131443 1.14 132953 4 1501 143815 1.03 145316 5 1333 142149 0.93 143482 6 1372 143663 0.95 145035 7 1316 129535 1.01 130851 8 1370 138952 0.98 140322 9 1277 138954 0.91 140231 10 1228 138199 0.88 139427 11 1250 137877 0.90 139127 12 1234 141835 0.86 143069 13 1215 140177 0.86 141392 14 1241 139802 0.88 141043 15 1288 142855 0.89 144143 16 1226 139227 0.87 140453 17 1093 139728 0.78 140821 18 1199 140609 0.85 141808 19 1205 140175 0.85 141380 20 1185 140632 0.84 141817 21 1180 143618 0.81 144798 22 1211 142721 0.84 143932 23 1269 140510 0.90 141779 24 1241 142045 0.87 143286 25 1249 137974 0.90 139223 26 1243 137674 0.89 138917 27 1232 141547 0.86 142779 28 1208 139727 0.86 140935 29 1288 139797 0.91 141085 30 1245 139498 0.88 140743 31 1324 140613 0.93 141937 32 1238 141491 0.87 142729 33 1262 144384 0.87 145646 34 1236 143254 0.86 144490 35 1246 142927 0.86 144173 36 1138 142344 0.79 143482 37 1262 141026 0.89 142288 38 1257 141485 0.88 142742 39 1227 142839 0.85 144066 40 1218 141745 0.85 142963 41 1122 141959 0.78 143081 42 1173 143651 0.81 144824 43 1234 142682 0.86 143916 44 1234 144323 0.85 145557 45 1295 144973 0.89 146268 46 1227 141299 0.86 142526 47 1222 140030 0.87 141252 48 1247 142899 0.87 144146 49 1231 142086 0.86 143317 50 1222 142030 0.85 143252 51 1198 142025 0.84 143223 52 1285 141724 0.90 143009 53 1219 143224 0.84 144443 54 1278 143589 0.88 144867 55 1228 144364 0.84 145592 56 1221 145118 0.83 146339 57 1160 142010 0.81 143170 58 1239 141438 0.87 142677 59 1250 140759 0.88 142009 60 1202 141930 0.84 143132 61 1195 142847 0.83 144042 62 1266 143150 0.88 144416 63 1276 142467 0.89 143743 64 1297 144209 0.89 145506 65 1311 143868 0.90 145179 66 1244 144460 0.85 145704 67 1252 144904 0.86 146156 68 1266 143779 0.87 145045 69 1247 143652 0.86 144899 70 1241 143077 0.86 144318 71 1260 142938 0.87 144198 72 1315 144073 0.90 145388 73 1256 144100 0.86 145356 74 1259 145018 0.86 146277 75 1245 141829 0.87 143074 76 1246 143388 0.86 144634 77 1272 143551 0.88 144823 78 1220 143262 0.84 144482 79 1192 143721 0.82 144913 80 1239 141914 0.87 143153 81 1211 143357 0.84 144568 82 1220 143792 0.84 145012 83 1254 144395 0.86 145649 84 1213 144491 0.83 145704 85 1324 146121 0.90 147445 86 1208 145554 0.82 146762 87 1262 145857 0.86 147119 88 1254 147096 0.85 148350 89 1288 146209 0.87 147497 90 1251 145852 0.85 147103 91 1259 144201 0.87 145460 92 1266 143771 0.87 145037 93 1248 145475 0.85 146723 94 1252 146732 0.85 147984 95 1216 145625 0.83 146841 96 1259 145221 0.86 146480 97 1250 145263 0.85 146513 98 1203 141769 0.84 142972 99 1210 141924 0.85 143134 100 1276 143662 0.88 144938 101 1280 142857 0.89 144137 102 1255 142926 0.87 144181 103 1262 141342 0.88 142604 104 1299 142228 0.91 143527 105 1219 143973 0.84 145192 106 1233 145909 0.84 147142 107 1285 145079 0.88 146364 108 1250 144644 0.86 145894 109 1239 143205 0.86 144444 110 1190 141900 0.83 143090 111 1248 143491 0.86 144739 112 1284 142657 0.89 143941 113 1224 144214 0.84 145438 114 1218 143489 0.84 144707 115 1215 143348 0.84 144563 116 1216 143453 0.84 144669 117 1203 144368 0.83 145571 118 1232 145502 0.84 146734 119 1224 142087 0.85 143311 120 1245 141596 0.87 142841 121 1253 142160 0.87 143413 122 1187 142632 0.83 143819 123 1182 142309 0.82 143491 124 1211 141647 0.85 142858 125 1189 141774 0.83 142963 126 1209 143711 0.83 144920 127 1259 143143 0.87 144402 128 1260 143134 0.87 144394 129 1242 144412 0.85 145654 130 1257 141085 0.88 142342 131 1243 140305 0.88 141548 132 1290 140640 0.91 141930 133 1232 141486 0.86 142718 134 1255 141707 0.88 142962 135 1283 141617 0.90 142900 136 1238 142134 0.86 143372 137 1198 143432 0.83 144630 138 1226 143344 0.85 144570 139 1245 142358 0.87 143603 140 1271 142796 0.88 144067 141 1252 142199 0.87 143451 142 1284 142093 0.90 143377 143 1172 141532 0.82 142704 144 1223 140887 0.86 142110 145 1210 140930 0.85 142140 146 1271 141692 0.89 142963 147 1326 141882 0.93 143208 148 1223 137863 0.88 139086 149 1274 139983 0.90 141257 150 1704 138410 1.22 140114 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1307 95629 1.35 96936 2 605 84476 0.71 85081 3 686 108018 0.63 108704 4 627 111586 0.56 112213 5 547 109760 0.50 110307 6 477 102676 0.46 103153 7 514 105285 0.49 105799 8 534 106476 0.50 107010 9 512 104506 0.49 105018 10 495 105917 0.47 106412 11 461 106658 0.43 107119 12 537 107136 0.50 107673 13 510 104771 0.48 105281 14 471 106041 0.44 106512 15 514 105957 0.48 106471 16 486 105448 0.46 105934 17 486 106291 0.46 106777 18 518 105118 0.49 105636 19 480 106730 0.45 107210 20 490 104614 0.47 105104 21 486 106774 0.45 107260 22 525 106498 0.49 107023 23 500 108539 0.46 109039 24 474 108896 0.43 109370 25 527 108423 0.48 108950 26 542 108315 0.50 108857 27 496 108154 0.46 108650 28 492 109370 0.45 109862 29 487 108718 0.45 109205 30 587 108557 0.54 109144 31 501 109379 0.46 109880 32 528 110190 0.48 110718 33 520 111901 0.46 112421 34 528 110706 0.47 111234 35 524 108992 0.48 109516 36 476 107662 0.44 108138 37 542 109041 0.49 109583 38 468 109714 0.42 110182 39 529 109154 0.48 109683 40 500 108638 0.46 109138 41 475 108590 0.44 109065 42 493 111763 0.44 112256 43 545 111480 0.49 112025 44 500 110506 0.45 111006 45 469 109320 0.43 109789 46 508 108752 0.46 109260 47 478 107031 0.44 107509 48 534 109310 0.49 109844 49 511 108960 0.47 109471 50 531 108013 0.49 108544 51 482 107639 0.45 108121 52 490 108171 0.45 108661 53 527 107991 0.49 108518 54 505 110725 0.45 111230 55 547 109844 0.50 110391 56 461 107574 0.43 108035 57 477 108143 0.44 108620 58 500 108767 0.46 109267 59 437 107465 0.40 107902 60 491 109488 0.45 109979 61 507 108715 0.46 109222 62 479 109611 0.44 110090 63 453 108561 0.42 109014 64 493 109455 0.45 109948 65 483 108526 0.44 109009 66 484 110696 0.44 111180 67 494 111410 0.44 111904 68 495 111084 0.44 111579 69 548 110441 0.49 110989 70 511 110040 0.46 110551 71 498 111658 0.44 112156 72 536 113237 0.47 113773 73 529 113720 0.46 114249 74 511 112654 0.45 113165 75 537 113243 0.47 113780 76 538 113648 0.47 114186 77 483 112348 0.43 112831 78 511 112903 0.45 113414 79 465 110243 0.42 110708 80 527 108358 0.48 108885 81 448 110622 0.40 111070 82 511 110580 0.46 111091 83 523 110395 0.47 110918 84 546 111315 0.49 111861 85 520 110835 0.47 111355 86 490 108173 0.45 108663 87 468 109667 0.42 110135 88 484 108749 0.44 109233 89 488 107373 0.45 107861 90 480 108843 0.44 109323 91 503 108002 0.46 108505 92 447 108673 0.41 109120 93 482 107186 0.45 107668 94 475 108194 0.44 108669 95 484 108820 0.44 109304 96 458 110513 0.41 110971 97 498 109693 0.45 110191 98 510 110162 0.46 110672 99 456 109691 0.41 110147 100 510 108856 0.47 109366 101 463 109874 0.42 110337 102 444 109639 0.40 110083 103 501 109441 0.46 109942 104 535 109099 0.49 109634 105 452 111084 0.41 111536 106 495 112552 0.44 113047 107 508 110849 0.46 111357 108 485 109434 0.44 109919 109 466 108229 0.43 108695 110 427 109435 0.39 109862 111 492 109657 0.45 110149 112 515 109500 0.47 110015 113 473 108264 0.43 108737 114 479 108155 0.44 108634 115 509 111498 0.45 112007 116 433 111166 0.39 111599 117 459 110475 0.41 110934 118 434 110030 0.39 110464 119 444 108044 0.41 108488 120 478 106305 0.45 106783 121 493 108765 0.45 109258 122 489 108911 0.45 109400 123 456 107660 0.42 108116 124 497 107880 0.46 108377 125 475 107363 0.44 107838 126 503 107708 0.46 108211 127 491 109895 0.44 110386 128 511 108691 0.47 109202 129 475 106441 0.44 106916 130 496 107794 0.46 108290 131 464 107591 0.43 108055 132 521 107059 0.48 107580 133 502 108740 0.46 109242 134 517 107470 0.48 107987 135 545 108698 0.50 109243 136 472 107657 0.44 108129 137 501 108218 0.46 108719 138 483 107323 0.45 107806 139 497 110007 0.45 110504 140 537 108857 0.49 109394 141 490 108410 0.45 108900 142 501 108162 0.46 108663 143 467 108374 0.43 108841 144 510 108853 0.47 109363 145 520 109219 0.47 109739 146 537 109800 0.49 110337 147 542 109167 0.49 109709 148 524 109317 0.48 109841 149 492 109450 0.45 109942 150 804 108872 0.73 109676 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 4559 304295 1.48 308854 2 2146 264683 0.80 266829 3 2182 313722 0.69 315904 4 2036 318122 0.64 320158 5 1675 310347 0.54 312022 6 1694 313539 0.54 315233 7 1713 306793 0.56 308506 8 1669 310023 0.54 311692 9 1630 306562 0.53 308192 10 1696 308591 0.55 310287 11 1616 311503 0.52 313119 12 1666 309991 0.53 311657 13 1647 309970 0.53 311617 14 1576 308983 0.51 310559 15 1548 312329 0.49 313877 16 1534 309756 0.49 311290 17 1600 309767 0.51 311367 18 1611 314199 0.51 315810 19 1520 310676 0.49 312196 20 1574 308674 0.51 310248 21 1583 310590 0.51 312173 22 1536 313871 0.49 315407 23 1620 316428 0.51 318048 24 1497 317461 0.47 318958 25 1706 314559 0.54 316265 26 1528 314653 0.48 316181 27 1609 314087 0.51 315696 28 1554 313547 0.49 315101 29 1580 316310 0.50 317890 30 1644 312671 0.52 314315 31 1493 311028 0.48 312521 32 1560 313299 0.50 314859 33 1583 313076 0.50 314659 34 1616 313860 0.51 315476 35 1558 313697 0.49 315255 36 1597 316889 0.50 318486 37 1666 312070 0.53 313736 38 1614 311417 0.52 313031 39 1541 312268 0.49 313809 40 1606 312781 0.51 314387 41 1595 314786 0.50 316381 42 1688 312385 0.54 314073 43 1532 313475 0.49 315007 44 1578 314044 0.50 315622 45 1617 315229 0.51 316846 46 1520 315153 0.48 316673 47 1553 316018 0.49 317571 48 1628 315120 0.51 316748 49 1517 312323 0.48 313840 50 1577 313536 0.50 315113 51 1585 316563 0.50 318148 52 1556 315856 0.49 317412 53 1487 314789 0.47 316276 54 1599 317891 0.50 319490 55 1597 316213 0.50 317810 56 1566 319756 0.49 321322 57 1590 318713 0.50 320303 58 1568 315670 0.49 317238 59 1525 314309 0.48 315834 60 1534 313190 0.49 314724 61 1546 313326 0.49 314872 62 1521 315306 0.48 316827 63 1538 314256 0.49 315794 64 1523 313211 0.48 314734 65 1506 314689 0.48 316195 66 1553 315499 0.49 317052 67 1546 317218 0.48 318764 68 1594 317273 0.50 318867 69 1623 311881 0.52 313504 70 1555 311555 0.50 313110 71 1589 308720 0.51 310309 72 1533 310986 0.49 312519 73 1584 309182 0.51 310766 74 1501 311488 0.48 312989 75 1450 307473 0.47 308923 76 1512 314356 0.48 315868 77 1479 312140 0.47 313619 78 1625 314151 0.51 315776 79 1481 311816 0.47 313297 80 1538 310122 0.49 311660 81 1413 309409 0.45 310822 82 1613 308965 0.52 310578 83 1538 310749 0.49 312287 84 1535 313490 0.49 315025 85 1655 311488 0.53 313143 86 1459 311616 0.47 313075 87 1418 309393 0.46 310811 88 1434 310377 0.46 311811 89 1532 307927 0.50 309459 90 1541 308443 0.50 309984 91 1510 310239 0.48 311749 92 1462 306050 0.48 307512 93 1467 305812 0.48 307279 94 1489 306260 0.48 307749 95 1520 307521 0.49 309041 96 1471 312991 0.47 314462 97 1518 312068 0.48 313586 98 1499 309166 0.48 310665 99 1413 309111 0.46 310524 100 1448 308078 0.47 309526 101 1507 308645 0.49 310152 102 1588 310711 0.51 312299 103 1597 308543 0.51 310140 104 1464 305857 0.48 307321 105 1474 308020 0.48 309494 106 1503 307971 0.49 309474 107 1508 308362 0.49 309870 108 1534 309032 0.49 310566 109 1410 310922 0.45 312332 110 1426 306908 0.46 308334 111 1505 305609 0.49 307114 112 1520 305680 0.49 307200 113 1520 307218 0.49 308738 114 1464 310461 0.47 311925 115 1436 306157 0.47 307593 116 1495 307935 0.48 309430 117 1422 308365 0.46 309787 118 1484 309949 0.48 311433 119 1510 309528 0.49 311038 120 1579 312634 0.50 314213 121 1535 310379 0.49 311914 122 1596 309492 0.51 311088 123 1422 310820 0.46 312242 124 1582 311943 0.50 313525 125 1499 310498 0.48 311997 126 1457 310063 0.47 311520 127 1576 313244 0.50 314820 128 1536 312150 0.49 313686 129 1581 317525 0.50 319106 130 1511 316129 0.48 317640 131 1530 311797 0.49 313327 132 1510 311962 0.48 313472 133 1539 309452 0.49 310991 134 1519 308215 0.49 309734 135 1508 312804 0.48 314312 136 1494 310481 0.48 311975 137 1530 309729 0.49 311259 138 1535 312733 0.49 314268 139 1554 311624 0.50 313178 140 1502 315585 0.47 317087 141 1532 315535 0.48 317067 142 1561 309431 0.50 310992 143 1564 307507 0.51 309071 144 1504 306283 0.49 307787 145 1493 307298 0.48 308791 146 1501 308017 0.48 309518 147 1504 310311 0.48 311815 148 1546 306216 0.50 307762 149 1505 311390 0.48 312895 150 2511 311031 0.80 313542 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2511 178669 1.39 181180 2 772 130603 0.59 131375 3 730 77102 0.94 77832 4 1212 122845 0.98 124057 5 1206 133313 0.90 134519 6 1211 130692 0.92 131903 7 1153 131002 0.87 132155 8 1108 118186 0.93 119294 9 1128 126212 0.89 127340 10 1168 126086 0.92 127254 11 1158 124508 0.92 125666 12 1138 121919 0.92 123057 13 1116 123280 0.90 124396 14 1137 122367 0.92 123504 15 1095 122432 0.89 123527 16 1162 123045 0.94 124207 17 1137 121539 0.93 122676 18 1117 119747 0.92 120864 19 1128 121571 0.92 122699 20 1093 119096 0.91 120189 21 1063 119823 0.88 120886 22 1062 118882 0.89 119944 23 1049 117859 0.88 118908 24 1092 116988 0.92 118080 25 1138 116563 0.97 117701 26 1104 115127 0.95 116231 27 1029 114600 0.89 115629 28 1024 115128 0.88 116152 29 1045 113569 0.91 114614 30 1037 113849 0.90 114886 31 1007 113306 0.88 114313 32 1040 112303 0.92 113343 33 1018 111748 0.90 112766 34 1037 111538 0.92 112575 35 997 110533 0.89 111530 36 1035 109709 0.93 110744 37 939 109052 0.85 109991 38 1009 108197 0.92 109206 39 1030 107550 0.95 108580 40 969 107639 0.89 108608 41 1039 106446 0.97 107485 42 971 104500 0.92 105471 43 902 104730 0.85 105632 44 981 104184 0.93 105165 45 959 103187 0.92 104146 46 960 102278 0.93 103238 47 988 101787 0.96 102775 48 910 100646 0.90 101556 49 946 100016 0.94 100962 50 903 98845 0.91 99748 51 895 98859 0.90 99754 52 907 96945 0.93 97852 53 791 96026 0.82 96817 54 822 95143 0.86 95965 55 841 94719 0.88 95560 56 866 93527 0.92 94393 57 830 92675 0.89 93505 58 874 92318 0.94 93192 59 785 90651 0.86 91436 60 801 90286 0.88 91087 61 850 89081 0.95 89931 62 847 87753 0.96 88600 63 817 86948 0.93 87765 64 712 86287 0.82 86999 65 782 85639 0.90 86421 66 797 84453 0.93 85250 67 742 83803 0.88 84545 68 752 82293 0.91 83045 69 702 81691 0.85 82393 70 736 80872 0.90 81608 71 716 80042 0.89 80758 72 700 78698 0.88 79398 73 732 77034 0.94 77766 74 664 76741 0.86 77405 75 664 75258 0.87 75922 76 691 75083 0.91 75774 77 643 73521 0.87 74164 78 652 72146 0.90 72798 79 624 72088 0.86 72712 80 645 70371 0.91 71016 81 594 69646 0.85 70240 82 586 68723 0.85 69309 83 549 67668 0.80 68217 84 557 66714 0.83 67271 85 565 65384 0.86 65949 86 577 64635 0.88 65212 87 517 62808 0.82 63325 88 536 62942 0.84 63478 89 538 61444 0.87 61982 90 531 60132 0.88 60663 91 552 59613 0.92 60165 92 501 57971 0.86 58472 93 496 57430 0.86 57926 94 466 56751 0.81 57217 95 426 55313 0.76 55739 96 433 53992 0.80 54425 97 450 53543 0.83 53993 98 493 52671 0.93 53164 99 424 51647 0.81 52071 100 424 50900 0.83 51324 101 402 50369 0.79 50771 102 387 49001 0.78 49388 103 414 48211 0.85 48625 104 357 46705 0.76 47062 105 425 46137 0.91 46562 106 343 45288 0.75 45631 107 367 44279 0.82 44646 108 364 43397 0.83 43761 109 338 42737 0.78 43075 110 306 41691 0.73 41997 111 313 40929 0.76 41242 112 325 39818 0.81 40143 113 303 39339 0.76 39642 114 300 38378 0.78 38678 115 317 37540 0.84 37857 116 282 36613 0.76 36895 117 282 36246 0.77 36528 118 254 35248 0.72 35502 119 262 34685 0.75 34947 120 246 33692 0.72 33938 121 261 32898 0.79 33159 122 250 32159 0.77 32409 123 261 31491 0.82 31752 124 288 30855 0.92 31143 125 222 29820 0.74 30042 126 223 29147 0.76 29370 127 237 28682 0.82 28919 128 216 27589 0.78 27805 129 179 27767 0.64 27946 130 219 26766 0.81 26985 131 206 25904 0.79 26110 132 208 25360 0.81 25568 133 182 24897 0.73 25079 134 200 23702 0.84 23902 135 175 23164 0.75 23339 136 190 23050 0.82 23240 137 155 22166 0.69 22321 138 159 21750 0.73 21909 139 160 21285 0.75 21445 140 149 20638 0.72 20787 141 152 20226 0.75 20378 142 130 19447 0.66 19577 143 168 19249 0.87 19417 144 129 18610 0.69 18739 145 127 17893 0.70 18020 146 125 17815 0.70 17940 147 110 17052 0.64 17162 148 127 16713 0.75 16840 149 121 16300 0.74 16421 150 94 15905 0.59 15999 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1353 88544 1.51 89897 2 908 130312 0.69 131220 3 540 97960 0.55 98500 4 407 71477 0.57 71884 5 476 95044 0.50 95520 6 544 101853 0.53 102397 7 476 99010 0.48 99486 8 427 93809 0.45 94236 9 458 93219 0.49 93677 10 437 95583 0.46 96020 11 426 94223 0.45 94649 12 416 94593 0.44 95009 13 447 93938 0.47 94385 14 414 93019 0.44 93433 15 430 93326 0.46 93756 16 416 92666 0.45 93082 17 401 92543 0.43 92944 18 410 91519 0.45 91929 19 401 91031 0.44 91432 20 418 91329 0.46 91747 21 382 90649 0.42 91031 22 401 89630 0.45 90031 23 404 90140 0.45 90544 24 365 89465 0.41 89830 25 389 88757 0.44 89146 26 413 88303 0.47 88716 27 395 88239 0.45 88634 28 373 88108 0.42 88481 29 386 87285 0.44 87671 30 411 87090 0.47 87501 31 385 86332 0.44 86717 32 367 86001 0.42 86368 33 428 86323 0.49 86751 34 409 84156 0.48 84565 35 371 84775 0.44 85146 36 349 84352 0.41 84701 37 402 83253 0.48 83655 38 369 82489 0.45 82858 39 344 82321 0.42 82665 40 336 80876 0.41 81212 41 340 80794 0.42 81134 42 337 80264 0.42 80601 43 349 78772 0.44 79121 44 355 78826 0.45 79181 45 303 78277 0.39 78580 46 377 77071 0.49 77448 47 322 76810 0.42 77132 48 337 76486 0.44 76823 49 348 75868 0.46 76216 50 365 75241 0.48 75606 51 330 74887 0.44 75217 52 317 73526 0.43 73843 53 323 73244 0.44 73567 54 312 72466 0.43 72778 55 322 71018 0.45 71340 56 319 70571 0.45 70890 57 295 70298 0.42 70593 58 314 69664 0.45 69978 59 280 69202 0.40 69482 60 273 68122 0.40 68395 61 292 67301 0.43 67593 62 314 66968 0.47 67282 63 284 65846 0.43 66130 64 305 65123 0.47 65428 65 276 64420 0.43 64696 66 253 63923 0.39 64176 67 288 62674 0.46 62962 68 268 62369 0.43 62637 69 277 61627 0.45 61904 70 248 60456 0.41 60704 71 264 60059 0.44 60323 72 245 59679 0.41 59924 73 275 58053 0.47 58328 74 235 57312 0.41 57547 75 244 57117 0.43 57361 76 222 56076 0.39 56298 77 246 55231 0.44 55477 78 230 54849 0.42 55079 79 216 53690 0.40 53906 80 220 53109 0.41 53329 81 216 52339 0.41 52555 82 236 51731 0.45 51967 83 219 50911 0.43 51130 84 225 50359 0.44 50584 85 222 48910 0.45 49132 86 210 48692 0.43 48902 87 220 47853 0.46 48073 88 219 46649 0.47 46868 89 221 46406 0.47 46627 90 170 45655 0.37 45825 91 208 44365 0.47 44573 92 187 43804 0.43 43991 93 212 43183 0.49 43395 94 196 42159 0.46 42355 95 182 41828 0.43 42010 96 170 40964 0.41 41134 97 177 40094 0.44 40271 98 181 39693 0.45 39874 99 182 38921 0.47 39103 100 168 38238 0.44 38406 101 169 37169 0.45 37338 102 171 36933 0.46 37104 103 158 36038 0.44 36196 104 155 35330 0.44 35485 105 160 34771 0.46 34931 106 163 33979 0.48 34142 107 130 33137 0.39 33267 108 126 32354 0.39 32480 109 145 31962 0.45 32107 110 149 31440 0.47 31589 111 139 30743 0.45 30882 112 143 29794 0.48 29937 113 122 29424 0.41 29546 114 127 28829 0.44 28956 115 145 28213 0.51 28358 116 129 27410 0.47 27539 117 114 26935 0.42 27049 118 90 26026 0.34 26116 119 116 25913 0.45 26029 120 104 25210 0.41 25314 121 109 24646 0.44 24755 122 107 23849 0.45 23956 123 105 23674 0.44 23779 124 115 23105 0.50 23220 125 90 22542 0.40 22632 126 74 21831 0.34 21905 127 94 21262 0.44 21356 128 87 21066 0.41 21153 129 74 20359 0.36 20433 130 76 20025 0.38 20101 131 82 19175 0.43 19257 132 95 18875 0.50 18970 133 82 18449 0.44 18531 134 76 18147 0.42 18223 135 72 17589 0.41 17661 136 88 17218 0.51 17306 137 73 16687 0.44 16760 138 80 16179 0.49 16259 139 75 15721 0.47 15796 140 71 15422 0.46 15493 141 63 15089 0.42 15152 142 61 14705 0.41 14766 143 65 14225 0.45 14290 144 68 13644 0.50 13712 145 65 13496 0.48 13561 146 62 13038 0.47 13100 147 62 13018 0.47 13080 148 50 12344 0.40 12394 149 51 12076 0.42 12127 150 51 11623 0.44 11674 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3766 268337 1.38 272103 2 1993 294284 0.67 296277 3 1892 297952 0.63 299844 4 1800 300174 0.60 301974 5 1592 280004 0.57 281596 6 1461 277865 0.52 279326 7 1540 282628 0.54 284168 8 1383 266407 0.52 267790 9 1433 272776 0.52 274209 10 1430 273159 0.52 274589 11 1388 272184 0.51 273572 12 1406 270052 0.52 271458 13 1410 270396 0.52 271806 14 1318 268172 0.49 269490 15 1327 265258 0.50 266585 16 1330 265393 0.50 266723 17 1309 262990 0.50 264299 18 1316 262448 0.50 263764 19 1328 262672 0.50 264000 20 1323 260241 0.51 261564 21 1308 259875 0.50 261183 22 1332 259753 0.51 261085 23 1261 256755 0.49 258016 24 1261 256039 0.49 257300 25 1266 253978 0.50 255244 26 1245 251731 0.49 252976 27 1193 251506 0.47 252699 28 1205 249281 0.48 250486 29 1140 247718 0.46 248858 30 1250 246021 0.51 247271 31 1223 245441 0.50 246664 32 1121 242925 0.46 244046 33 1204 242460 0.49 243664 34 1154 241486 0.48 242640 35 1157 237708 0.48 238865 36 1189 236570 0.50 237759 37 1204 235263 0.51 236467 38 1123 233571 0.48 234694 39 1100 230988 0.47 232088 40 1147 229284 0.50 230431 41 1133 227575 0.50 228708 42 1112 226309 0.49 227421 43 1071 224845 0.47 225916 44 1064 221785 0.48 222849 45 1050 220854 0.47 221904 46 1018 217819 0.47 218837 47 1027 216683 0.47 217710 48 1011 215341 0.47 216352 49 1024 212913 0.48 213937 50 996 211698 0.47 212694 51 951 208971 0.45 209922 52 1026 208071 0.49 209097 53 1001 205299 0.49 206300 54 908 203190 0.44 204098 55 973 201608 0.48 202581 56 954 200081 0.47 201035 57 910 197651 0.46 198561 58 935 195297 0.48 196232 59 948 192944 0.49 193892 60 1008 192343 0.52 193351 61 893 189384 0.47 190277 62 913 186871 0.49 187784 63 885 185107 0.48 185992 64 905 183006 0.49 183911 65 880 180222 0.49 181102 66 898 178272 0.50 179170 67 881 176845 0.50 177726 68 851 174759 0.48 175610 69 786 172494 0.45 173280 70 780 170321 0.46 171101 71 818 168057 0.48 168875 72 807 165784 0.48 166591 73 777 164672 0.47 165449 74 787 161154 0.49 161941 75 766 159572 0.48 160338 76 735 157443 0.46 158178 77 756 154986 0.49 155742 78 722 153412 0.47 154134 79 725 151512 0.48 152237 80 706 149341 0.47 150047 81 724 146942 0.49 147666 82 714 145316 0.49 146030 83 693 142535 0.48 143228 84 759 140831 0.54 141590 85 655 138413 0.47 139068 86 657 135874 0.48 136531 87 656 134080 0.49 134736 88 636 131960 0.48 132596 89 655 129142 0.50 129797 90 628 127797 0.49 128425 91 564 126297 0.44 126861 92 612 123340 0.49 123952 93 600 121485 0.49 122085 94 590 119633 0.49 120223 95 571 116862 0.49 117433 96 508 114512 0.44 115020 97 506 112688 0.45 113194 98 535 111093 0.48 111628 99 573 108860 0.52 109433 100 532 106643 0.50 107175 101 529 104453 0.50 104982 102 506 102958 0.49 103464 103 469 101271 0.46 101740 104 464 99225 0.47 99689 105 502 97495 0.51 97997 106 490 95690 0.51 96180 107 441 93161 0.47 93602 108 452 91539 0.49 91991 109 460 89141 0.51 89601 110 409 87426 0.47 87835 111 426 86596 0.49 87022 112 400 84192 0.47 84592 113 395 82005 0.48 82400 114 409 80212 0.51 80621 115 374 79187 0.47 79561 116 354 77186 0.46 77540 117 373 75412 0.49 75785 118 345 73560 0.47 73905 119 332 71866 0.46 72198 120 340 70506 0.48 70846 121 316 68801 0.46 69117 122 315 67713 0.46 68028 123 334 65832 0.50 66166 124 319 64512 0.49 64831 125 305 62538 0.49 62843 126 288 61316 0.47 61604 127 275 59866 0.46 60141 128 301 58203 0.51 58504 129 268 56942 0.47 57210 130 279 55262 0.50 55541 131 305 54078 0.56 54383 132 283 52645 0.53 52928 133 239 51979 0.46 52218 134 251 50454 0.50 50705 135 260 49072 0.53 49332 136 210 47919 0.44 48129 137 225 46967 0.48 47192 138 220 45228 0.48 45448 139 220 44272 0.49 44492 140 227 42995 0.53 43222 141 216 41785 0.51 42001 142 206 41007 0.50 41213 143 200 39814 0.50 40014 144 207 39171 0.53 39378 145 190 37891 0.50 38081 146 192 36727 0.52 36919 147 160 35608 0.45 35768 148 162 34936 0.46 35098 149 163 33475 0.48 33638 150 166 32606 0.51 32772