CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1561073 757523 67.33 2318596 2 1087267 460605 70.24 1547872 3 1396629 708526 66.34 2105155 4 1481905 785913 65.34 2267818 5 1557236 779013 66.66 2336249 6 1594996 801134 66.57 2396130 7 1453269 724423 66.73 2177692 8 1586525 773979 67.21 2360504 9 1532204 763601 66.74 2295805 10 1488084 753748 66.38 2241832 11 1471577 755658 66.07 2227235 12 1482058 771386 65.77 2253444 13 1502642 757299 66.49 2259941 14 1498917 781890 65.72 2280807 15 1501949 759859 66.40 2261808 16 1533988 794199 65.89 2328187 17 1536909 773003 66.54 2309912 18 1507618 767305 66.27 2274923 19 1491598 781883 65.61 2273481 20 1548448 775587 66.63 2324035 21 1564843 781623 66.69 2346466 22 1554571 782134 66.53 2336705 23 1566141 780503 66.74 2346644 24 1534409 801630 65.68 2336039 25 1572629 790609 66.55 2363238 26 1516493 806021 65.30 2322514 27 1514267 803443 65.33 2317710 28 1569161 790085 66.51 2359246 29 1553311 793051 66.20 2346362 30 1605004 802823 66.66 2407827 31 1575855 816200 65.88 2392055 32 1631851 806683 66.92 2438534 33 1550668 809118 65.71 2359786 34 1533616 801819 65.67 2335435 35 1574780 798522 66.35 2373302 36 1585910 809568 66.20 2395478 37 1593473 802975 66.49 2396448 38 1626362 821723 66.43 2448085 39 1590673 814349 66.14 2405022 40 1627418 808672 66.80 2436090 41 1595455 806740 66.42 2402195 42 1584820 801514 66.41 2386334 43 1620670 809820 66.68 2430490 44 1632786 809860 66.84 2442646 45 1638377 813147 66.83 2451524 46 1597802 823019 66.00 2420821 47 1600434 805585 66.52 2406019 48 1595334 827267 65.85 2422601 49 1630083 814168 66.69 2444251 50 1629691 812037 66.74 2441728 51 1616886 804635 66.77 2421521 52 1628255 809970 66.78 2438225 53 1636401 812926 66.81 2449327 54 1661701 838359 66.47 2500060 55 1622121 829993 66.15 2452114 56 1644773 813688 66.90 2458461 57 1636367 814769 66.76 2451136 58 1630850 824303 66.43 2455153 59 1653951 817235 66.93 2471186 60 1667415 819638 67.04 2487053 61 1648065 828111 66.56 2476176 62 1684362 823761 67.16 2508123 63 1673194 818495 67.15 2491689 64 1653594 828386 66.62 2481980 65 1648701 814326 66.94 2463027 66 1642648 812532 66.91 2455180 67 1655610 817651 66.94 2473261 68 1672793 821391 67.07 2494184 69 1674597 817618 67.19 2492215 70 1690688 823991 67.23 2514679 71 1667593 817210 67.11 2484803 72 1667394 817623 67.10 2485017 73 1666901 821420 66.99 2488321 74 1659680 816836 67.02 2476516 75 1660092 833095 66.59 2493187 76 1682945 821273 67.20 2504218 77 1667996 818392 67.09 2486388 78 1662602 830429 66.69 2493031 79 1665009 819692 67.01 2484701 80 1685507 821586 67.23 2507093 81 1663000 829242 66.73 2492242 82 1664860 832633 66.66 2497493 83 1684355 820130 67.25 2504485 84 1670134 832840 66.73 2502974 85 1668532 834415 66.66 2502947 86 1691226 824086 67.24 2515312 87 1684808 821487 67.22 2506295 88 1693354 824550 67.25 2517904 89 1693814 823239 67.29 2517053 90 1691539 824892 67.22 2516431 91 1670312 829788 66.81 2500100 92 1698511 823585 67.35 2522096 93 1703541 823332 67.42 2526873 94 1710473 838206 67.11 2548679 95 1703708 827113 67.32 2530821 96 1691886 831345 67.05 2523231 97 1694129 828156 67.17 2522285 98 1674636 835214 66.72 2509850 99 1714160 835851 67.22 2550011 100 1702330 830172 67.22 2532502 101 1701926 826172 67.32 2528098 102 1695463 835967 66.98 2531430 103 1688730 836873 66.86 2525603 104 1677547 840618 66.62 2518165 105 1708139 840583 67.02 2548722 106 1706580 827571 67.34 2534151 107 1701283 836492 67.04 2537775 108 1703022 828747 67.27 2531769 109 1685013 835051 66.86 2520064 110 1682966 824927 67.11 2507893 111 1698518 826340 67.27 2524858 112 1687014 829453 67.04 2516467 113 1679260 826739 67.01 2505999 114 1699736 834969 67.06 2534705 115 1696317 831434 67.11 2527751 116 1697789 833681 67.07 2531470 117 1715114 839681 67.13 2554795 118 1713566 836751 67.19 2550317 119 1692866 833089 67.02 2525955 120 1692962 839019 66.86 2531981 121 1690713 833177 66.99 2523890 122 1707687 830926 67.27 2538613 123 1700764 833571 67.11 2534335 124 1685958 840172 66.74 2526130 125 1707879 838841 67.06 2546720 126 1721441 838914 67.23 2560355 127 1722404 838441 67.26 2560845 128 1711920 835875 67.19 2547795 129 1712835 840603 67.08 2553438 130 1707861 836054 67.14 2543915 131 1710006 837047 67.14 2547053 132 1711731 837125 67.16 2548856 133 1708771 836096 67.15 2544867 134 1716671 841642 67.10 2558313 135 1704934 837541 67.06 2542475 136 1687967 838884 66.80 2526851 137 1678639 840171 66.64 2518810 138 1692298 839355 66.85 2531653 139 1699877 843925 66.82 2543802 140 1686145 845796 66.59 2531941 141 1671465 840397 66.54 2511862 142 1682772 844007 66.60 2526779 143 1673694 841242 66.55 2514936 144 1670302 845718 66.39 2516020 145 1665652 844722 66.35 2510374 146 1662131 847356 66.23 2509487 147 1660090 850179 66.13 2510269 148 1649953 848533 66.04 2498486 149 1620340 852113 65.54 2472453 150 1662054 856905 65.98 2518959 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 120141 7874579 1.50 7994720 2 53249 6258012 0.84 6311261 3 54977 7750838 0.70 7805815 4 53332 8295844 0.64 8349176 5 48562 8329320 0.58 8377882 6 47241 8152291 0.58 8199532 7 47254 8303551 0.57 8350805 8 47463 8268741 0.57 8316204 9 46302 8093025 0.57 8139327 10 45653 8102301 0.56 8147954 11 43872 8067994 0.54 8111866 12 47266 8210361 0.57 8257627 13 46639 8304151 0.56 8350790 14 46275 8208005 0.56 8254280 15 47051 8349588 0.56 8396639 16 46570 8277398 0.56 8323968 17 44234 8236696 0.53 8280930 18 46259 8334653 0.55 8380912 19 47861 8385655 0.57 8433516 20 46358 8350271 0.55 8396629 21 45568 8377927 0.54 8423495 22 46026 8382113 0.55 8428139 23 47172 8371096 0.56 8418268 24 48062 8629551 0.55 8677613 25 46802 8457615 0.55 8504417 26 47811 8368562 0.57 8416373 27 51250 8454956 0.60 8506206 28 47163 8557481 0.55 8604644 29 46917 8643914 0.54 8690831 30 47374 8550858 0.55 8598232 31 47307 8488506 0.55 8535813 32 47796 8541810 0.56 8589606 33 48992 8554121 0.57 8603113 34 48164 8475178 0.57 8523342 35 46554 8531677 0.54 8578231 36 47646 8509700 0.56 8557346 37 46907 8660666 0.54 8707573 38 48985 8683685 0.56 8732670 39 48839 8564032 0.57 8612871 40 47625 8561137 0.55 8608762 41 48853 8517386 0.57 8566239 42 46214 8588303 0.54 8634517 43 47189 8651936 0.54 8699125 44 47724 8627772 0.55 8675496 45 48253 8684469 0.55 8732722 46 47763 8607533 0.55 8655296 47 46679 8659595 0.54 8706274 48 50159 8708459 0.57 8758618 49 46504 8653744 0.53 8700248 50 47266 8650199 0.54 8697465 51 46915 8607778 0.54 8654693 52 46958 8588264 0.54 8635222 53 46357 8692723 0.53 8739080 54 48200 8706223 0.55 8754423 55 49230 8659304 0.57 8708534 56 45884 8662439 0.53 8708323 57 46614 8654493 0.54 8701107 58 47843 8640710 0.55 8688553 59 46826 8652151 0.54 8698977 60 46927 8675185 0.54 8722112 61 48171 8703596 0.55 8751767 62 47436 8757105 0.54 8804541 63 46956 8710606 0.54 8757562 64 48841 8655626 0.56 8704467 65 46296 8633812 0.53 8680108 66 47344 8675096 0.54 8722440 67 47052 8740289 0.54 8787341 68 47614 8759489 0.54 8807103 69 47761 8755299 0.54 8803060 70 47146 8670082 0.54 8717228 71 46623 8640697 0.54 8687320 72 47226 8717932 0.54 8765158 73 47267 8699958 0.54 8747225 74 47666 8698234 0.55 8745900 75 47951 8706256 0.55 8754207 76 46901 8728352 0.53 8775253 77 46464 8738687 0.53 8785151 78 48161 8771745 0.55 8819906 79 46483 8704058 0.53 8750541 80 47139 8753933 0.54 8801072 81 47059 8734711 0.54 8781770 82 49291 8759512 0.56 8808803 83 47405 8735667 0.54 8783072 84 48391 8736800 0.55 8785191 85 50356 8803308 0.57 8853664 86 46644 8811533 0.53 8858177 87 47805 8795414 0.54 8843219 88 47504 8770939 0.54 8818443 89 48041 8764626 0.55 8812667 90 47816 8741855 0.54 8789671 91 48556 8801781 0.55 8850337 92 47285 8794524 0.53 8841809 93 47710 8784533 0.54 8832243 94 48096 8750702 0.55 8798798 95 47469 8752521 0.54 8799990 96 46894 8762157 0.53 8809051 97 46792 8752526 0.53 8799318 98 48663 8776179 0.55 8824842 99 46497 8781289 0.53 8827786 100 46400 8769257 0.53 8815657 101 47844 8813733 0.54 8861577 102 48155 8790432 0.54 8838587 103 48604 8754673 0.55 8803277 104 49608 8777639 0.56 8827247 105 46329 8798681 0.52 8845010 106 47391 8794213 0.54 8841604 107 47998 8772371 0.54 8820369 108 47346 8774275 0.54 8821621 109 47538 8849639 0.53 8897177 110 46485 8834003 0.52 8880488 111 47513 8794167 0.54 8841680 112 46510 8819655 0.52 8866165 113 47799 8868529 0.54 8916328 114 47051 8812973 0.53 8860024 115 46287 8794833 0.52 8841120 116 47057 8792998 0.53 8840055 117 46702 8817373 0.53 8864075 118 46998 8803515 0.53 8850513 119 46800 8782966 0.53 8829766 120 47325 8783239 0.54 8830564 121 46755 8819078 0.53 8865833 122 47426 8789414 0.54 8836840 123 46930 8766115 0.53 8813045 124 47031 8793288 0.53 8840319 125 47007 8811761 0.53 8858768 126 46845 8790223 0.53 8837068 127 47119 8780547 0.53 8827666 128 46983 8762127 0.53 8809110 129 46518 8779867 0.53 8826385 130 46575 8770798 0.53 8817373 131 46524 8764099 0.53 8810623 132 47517 8779814 0.54 8827331 133 47381 8813774 0.53 8861155 134 47237 8822383 0.53 8869620 135 46982 8783272 0.53 8830254 136 46970 8745241 0.53 8792211 137 46166 8739566 0.53 8785732 138 47060 8753898 0.53 8800958 139 46903 8760996 0.53 8807899 140 46654 8775609 0.53 8822263 141 46604 8790584 0.53 8837188 142 47110 8764012 0.53 8811122 143 46975 8758676 0.53 8805651 144 47096 8735695 0.54 8782791 145 47303 8732257 0.54 8779560 146 47338 8722570 0.54 8769908 147 47229 8717206 0.54 8764435 148 47404 8715601 0.54 8763005 149 47609 8724441 0.54 8772050 150 65715 8690136 0.75 8755851 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 338549 24829248 1.35 25167797 2 170765 21392674 0.79 21563439 3 171608 25255927 0.67 25427535 4 161334 26218647 0.61 26379981 5 140210 25599809 0.54 25740019 6 139158 25902214 0.53 26041372 7 133274 25279879 0.52 25413153 8 136007 25516020 0.53 25652027 9 133284 25222469 0.53 25355753 10 132535 25272763 0.52 25405298 11 127690 25304907 0.50 25432597 12 134985 25388859 0.53 25523844 13 131991 25346608 0.52 25478599 14 132832 25547082 0.52 25679914 15 133128 25472837 0.52 25605965 16 131201 25454022 0.51 25585223 17 126304 25592970 0.49 25719274 18 132232 25738447 0.51 25870679 19 133166 25713637 0.52 25846803 20 130209 25567565 0.51 25697774 21 127459 25483137 0.50 25610596 22 129796 25753544 0.50 25883340 23 132074 25755959 0.51 25888033 24 131095 25602364 0.51 25733459 25 129692 25629858 0.50 25759550 26 134061 25680479 0.52 25814540 27 142311 25838885 0.55 25981196 28 129437 25826369 0.50 25955806 29 126581 25565945 0.49 25692526 30 130199 25666429 0.50 25796628 31 132280 25701369 0.51 25833649 32 130429 25739794 0.50 25870223 33 132864 25739488 0.51 25872352 34 132574 25719622 0.51 25852196 35 129856 25982272 0.50 26112128 36 133892 25909926 0.51 26043818 37 127284 25844436 0.49 25971720 38 133180 25829207 0.51 25962387 39 136197 25812396 0.52 25948593 40 131013 25724943 0.51 25855956 41 133582 25750088 0.52 25883670 42 126749 25832759 0.49 25959508 43 128319 25752035 0.50 25880354 44 129345 25833387 0.50 25962732 45 131230 25788617 0.51 25919847 46 130422 25742597 0.50 25873019 47 127180 25775183 0.49 25902363 48 134960 25839910 0.52 25974870 49 125043 25817370 0.48 25942413 50 128053 25733502 0.50 25861555 51 128046 25764477 0.49 25892523 52 128886 25766088 0.50 25894974 53 125793 25733387 0.49 25859180 54 130459 25757938 0.50 25888397 55 133327 25676758 0.52 25810085 56 122693 25731295 0.47 25853988 57 125619 25759327 0.49 25884946 58 130076 25806638 0.50 25936714 59 126788 25846024 0.49 25972812 60 128591 25952458 0.49 26081049 61 129184 25830741 0.50 25959925 62 126887 25816080 0.49 25942967 63 126657 25805688 0.49 25932345 64 132201 25780412 0.51 25912613 65 126621 25807844 0.49 25934465 66 128749 25936250 0.49 26064999 67 127266 25956759 0.49 26084025 68 126997 25836687 0.49 25963684 69 126819 25786601 0.49 25913420 70 129176 25729551 0.50 25858727 71 126223 25801844 0.49 25928067 72 127995 25799908 0.49 25927903 73 127775 25771796 0.49 25899571 74 127738 25745417 0.49 25873155 75 128077 25727250 0.50 25855327 76 124675 25736325 0.48 25861000 77 124181 25676904 0.48 25801085 78 129059 25599725 0.50 25728784 79 123979 25602718 0.48 25726697 80 126859 25706340 0.49 25833199 81 125784 25609781 0.49 25735565 82 131658 25598401 0.51 25730059 83 126823 25577188 0.49 25704011 84 129136 25637210 0.50 25766346 85 133067 25751211 0.51 25884278 86 123432 25737170 0.48 25860602 87 125901 25681630 0.49 25807531 88 125559 25718047 0.49 25843606 89 127307 25692159 0.49 25819466 90 127976 25787694 0.49 25915670 91 128067 25793770 0.49 25921837 92 124829 25749034 0.48 25873863 93 126905 25719176 0.49 25846081 94 128343 25779634 0.50 25907977 95 126468 25783337 0.49 25909805 96 125291 25830279 0.48 25955570 97 124799 25804880 0.48 25929679 98 129792 25849665 0.50 25979457 99 122957 25822797 0.47 25945754 100 124420 25747023 0.48 25871443 101 127290 25706779 0.49 25834069 102 128968 25736757 0.50 25865725 103 131640 25730926 0.51 25862566 104 132809 25819443 0.51 25952252 105 122808 25726757 0.48 25849565 106 127718 25723711 0.49 25851429 107 129131 25765187 0.50 25894318 108 126204 25747267 0.49 25873471 109 124709 25757699 0.48 25882408 110 123217 25720009 0.48 25843226 111 126201 25706059 0.49 25832260 112 124227 25737430 0.48 25861657 113 124308 25680266 0.48 25804574 114 124315 25664975 0.48 25789290 115 124572 25704050 0.48 25828622 116 125391 25763008 0.48 25888399 117 123264 25778764 0.48 25902028 118 124895 25732222 0.48 25857117 119 125773 25722109 0.49 25847882 120 126786 25748909 0.49 25875695 121 124425 25765110 0.48 25889535 122 126880 25734753 0.49 25861633 123 125642 25763524 0.49 25889166 124 125605 25780013 0.48 25905618 125 124587 25776497 0.48 25901084 126 126279 25782487 0.49 25908766 127 127136 25747569 0.49 25874705 128 126719 25753065 0.49 25879784 129 125325 25812883 0.48 25938208 130 125651 25803936 0.48 25929587 131 126432 25805710 0.49 25932142 132 127558 25805340 0.49 25932898 133 127071 25786496 0.49 25913567 134 126732 25787463 0.49 25914195 135 127417 25775060 0.49 25902477 136 126775 25755973 0.49 25882748 137 124275 25769107 0.48 25893382 138 126024 25780869 0.49 25906893 139 125856 25811307 0.49 25937163 140 124273 25791876 0.48 25916149 141 125802 25757423 0.49 25883225 142 126383 25734684 0.49 25861067 143 125985 25693082 0.49 25819067 144 126068 25682423 0.49 25808491 145 126935 25687581 0.49 25814516 146 126458 25660105 0.49 25786563 147 126143 25640707 0.49 25766850 148 125695 25558915 0.49 25684610 149 125909 25531218 0.49 25657127 150 176974 25450842 0.69 25627816 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 58281 4081330 1.41 4139611 2 51975 2331236 2.18 2383211 3 623445 1074949 36.71 1698394 4 1125848 1082782 50.97 2208630 5 1339444 996926 57.33 2336370 6 1412209 954458 59.67 2366667 7 1506384 964389 60.97 2470773 8 1359313 861841 61.20 2221154 9 1514529 890029 62.99 2404558 10 1447276 863996 62.62 2311272 11 1414112 832468 62.95 2246580 12 1435689 823065 63.56 2258754 13 1436661 809225 63.97 2245886 14 1445577 799205 64.40 2244782 15 1490752 807587 64.86 2298339 16 1454767 794154 64.69 2248921 17 1502199 790165 65.53 2292364 18 1484558 782886 65.47 2267444 19 1452850 770896 65.33 2223746 20 1457453 771549 65.39 2229002 21 1489571 770406 65.91 2259977 22 1488561 769048 65.94 2257609 23 1493167 766040 66.09 2259207 24 1488469 760279 66.19 2248748 25 1488087 760770 66.17 2248857 26 1493147 759614 66.28 2252761 27 1460189 752841 65.98 2213030 28 1440825 742238 66.00 2183063 29 1465057 744922 66.29 2209979 30 1461706 740648 66.37 2202354 31 1486876 744047 66.65 2230923 32 1480650 737459 66.75 2218109 33 1493795 735989 66.99 2229784 34 1436667 722823 66.53 2159490 35 1417503 714396 66.49 2131899 36 1437499 719543 66.64 2157042 37 1434999 715386 66.73 2150385 38 1439123 711973 66.90 2151096 39 1480494 715262 67.43 2195756 40 1424492 702367 66.98 2126859 41 1444756 702389 67.29 2147145 42 1417466 692271 67.19 2109737 43 1395834 683852 67.12 2079686 44 1402553 679835 67.35 2082388 45 1402880 680076 67.35 2082956 46 1390317 677896 67.22 2068213 47 1400710 672341 67.57 2073051 48 1362325 657918 67.43 2020243 49 1349937 654970 67.33 2004907 50 1339290 651635 67.27 1990925 51 1333505 645293 67.39 1978798 52 1318641 637210 67.42 1955851 53 1303324 630027 67.41 1933351 54 1291428 623384 67.44 1914812 55 1306854 625575 67.63 1932429 56 1275390 614808 67.47 1890198 57 1271414 607892 67.65 1879306 58 1249280 601012 67.52 1850292 59 1245816 596125 67.64 1841941 60 1220836 589143 67.45 1809979 61 1220539 586451 67.55 1806990 62 1216103 579274 67.74 1795377 63 1208608 574010 67.80 1782618 64 1197433 565401 67.93 1762834 65 1168372 557664 67.69 1726036 66 1148351 552395 67.52 1700746 67 1128330 543320 67.50 1671650 68 1136989 538074 67.88 1675063 69 1124250 533637 67.81 1657887 70 1113320 529290 67.78 1642610 71 1118504 526076 68.01 1644580 72 1079418 513583 67.76 1593001 73 1066968 507565 67.76 1574533 74 1054687 500853 67.80 1555540 75 1030380 493618 67.61 1523998 76 1020116 489804 67.56 1509920 77 1013740 480200 67.86 1493940 78 989491 472747 67.67 1462238 79 986874 467562 67.85 1454436 80 964109 461383 67.63 1425492 81 949508 452849 67.71 1402357 82 938410 446556 67.76 1384966 83 932314 441362 67.87 1373676 84 911363 432287 67.83 1343650 85 899647 426364 67.85 1326011 86 882560 421351 67.69 1303911 87 878862 414497 67.95 1293359 88 850755 405490 67.72 1256245 89 842568 400147 67.80 1242715 90 824594 393295 67.71 1217889 91 808375 386675 67.64 1195050 92 796154 380222 67.68 1176376 93 779183 372183 67.67 1151366 94 767169 366431 67.68 1133600 95 767203 363243 67.87 1130446 96 742330 355438 67.62 1097768 97 724773 346915 67.63 1071688 98 712836 341970 67.58 1054806 99 699572 335084 67.61 1034656 100 687216 330613 67.52 1017829 101 670769 324238 67.41 995007 102 659619 316516 67.57 976135 103 652999 311886 67.68 964885 104 634330 304386 67.57 938716 105 617644 298417 67.42 916061 106 612504 293624 67.60 906128 107 603417 288291 67.67 891708 108 590846 281641 67.72 872487 109 572966 275693 67.51 848659 110 561835 271452 67.42 833287 111 553401 266575 67.49 819976 112 540680 260720 67.47 801400 113 522260 254627 67.22 776887 114 513888 248617 67.39 762505 115 508059 244610 67.50 752669 116 492560 239011 67.33 731571 117 485261 233417 67.52 718678 118 476715 229427 67.51 706142 119 469391 224565 67.64 693956 120 456438 219403 67.54 675841 121 446405 214776 67.52 661181 122 437702 211463 67.43 649165 123 429623 206330 67.56 635953 124 417242 200059 67.59 617301 125 408984 197139 67.48 606123 126 400606 193621 67.42 594227 127 401519 189869 67.89 591388 128 389562 185229 67.77 574791 129 376954 181065 67.55 558019 130 370652 177083 67.67 547735 131 363400 173746 67.65 537146 132 352304 169376 67.53 521680 133 343704 165590 67.49 509294 134 334706 160717 67.56 495423 135 326487 156973 67.53 483460 136 316868 154076 67.28 470944 137 304775 149132 67.14 453907 138 297274 145352 67.16 442626 139 293541 142290 67.35 435831 140 284138 139570 67.06 423708 141 274936 136306 66.86 411242 142 266687 132568 66.80 399255 143 261693 129560 66.89 391253 144 253647 125415 66.91 379062 145 245534 122933 66.64 368467 146 237717 119607 66.53 357324 147 230659 116771 66.39 347430 148 225399 113803 66.45 339202 149 218715 110312 66.47 329027 150 212866 107602 66.42 320468 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 99515 7465599 1.32 7565114 2 73518 10454346 0.70 10527864 3 51650 8399458 0.61 8451108 4 39064 6468678 0.60 6507742 5 45325 7911062 0.57 7956387 6 48152 8479570 0.56 8527722 7 46124 8388651 0.55 8434775 8 44807 8177206 0.54 8222013 9 45785 8325833 0.55 8371618 10 45002 8300823 0.54 8345825 11 43299 8099898 0.53 8143197 12 42729 8026470 0.53 8069199 13 42341 7934292 0.53 7976633 14 43634 8153792 0.53 8197426 15 44077 8187678 0.54 8231755 16 43467 8127145 0.53 8170612 17 43984 8191868 0.53 8235852 18 43376 8083139 0.53 8126515 19 43071 8041277 0.53 8084348 20 43631 8094595 0.54 8138226 21 43566 8075513 0.54 8119079 22 42677 8032960 0.53 8075637 23 43144 8082591 0.53 8125735 24 43158 8027468 0.53 8070626 25 42628 7947497 0.53 7990125 26 44304 8203703 0.54 8248007 27 43326 8018350 0.54 8061676 28 43384 7950039 0.54 7993423 29 42213 7933443 0.53 7975656 30 42918 7931263 0.54 7974181 31 43653 8038496 0.54 8082149 32 42923 7920642 0.54 7963565 33 41811 7762152 0.54 7803963 34 41931 7786544 0.54 7828475 35 41168 7715443 0.53 7756611 36 40955 7583151 0.54 7624106 37 41260 7593690 0.54 7634950 38 39809 7519733 0.53 7559542 39 40948 7553300 0.54 7594248 40 40969 7635464 0.53 7676433 41 39840 7438351 0.53 7478191 42 38924 7353577 0.53 7392501 43 39255 7302866 0.53 7342121 44 39265 7289724 0.54 7328989 45 38813 7254814 0.53 7293627 46 39145 7248173 0.54 7287318 47 39140 7242454 0.54 7281594 48 38919 7149037 0.54 7187956 49 38676 7105554 0.54 7144230 50 38564 7100611 0.54 7139175 51 37691 6953854 0.54 6991545 52 37533 6939493 0.54 6977026 53 37250 6853778 0.54 6891028 54 36929 6743755 0.54 6780684 55 37166 6837714 0.54 6874880 56 37297 6774287 0.55 6811584 57 35988 6621913 0.54 6657901 58 36168 6592132 0.55 6628300 59 35980 6526316 0.55 6562296 60 35059 6428799 0.54 6463858 61 34969 6374701 0.55 6409670 62 34358 6282891 0.54 6317249 63 34212 6257459 0.54 6291671 64 34297 6231422 0.55 6265719 65 33862 6149447 0.55 6183309 66 32929 6019544 0.54 6052473 67 32645 5926135 0.55 5958780 68 32232 5846536 0.55 5878768 69 32235 5826691 0.55 5858926 70 32217 5796827 0.55 5829044 71 31895 5752283 0.55 5784178 72 31369 5635981 0.55 5667350 73 30334 5511600 0.55 5541934 74 30235 5479149 0.55 5509384 75 29993 5394911 0.55 5424904 76 29515 5339486 0.55 5369001 77 29803 5265581 0.56 5295384 78 28902 5196176 0.55 5225078 79 28647 5144032 0.55 5172679 80 27791 5082855 0.54 5110646 81 27328 4971807 0.55 4999135 82 27310 4922393 0.55 4949703 83 26962 4833439 0.55 4860401 84 26485 4780700 0.55 4807185 85 25639 4672666 0.55 4698305 86 25678 4599710 0.56 4625388 87 25233 4559721 0.55 4584954 88 24896 4502593 0.55 4527489 89 24409 4419535 0.55 4443944 90 23827 4342566 0.55 4366393 91 23582 4289660 0.55 4313242 92 23154 4190921 0.55 4214075 93 22956 4149463 0.55 4172419 94 22324 4096372 0.54 4118696 95 22350 4024797 0.55 4047147 96 22072 3966176 0.55 3988248 97 21616 3866506 0.56 3888122 98 20990 3795640 0.55 3816630 99 20963 3744205 0.56 3765168 100 20386 3692001 0.55 3712387 101 19854 3613691 0.55 3633545 102 19855 3542850 0.56 3562705 103 19370 3488724 0.55 3508094 104 18954 3420428 0.55 3439382 105 18655 3342814 0.55 3361469 106 18367 3275663 0.56 3294030 107 17884 3214306 0.55 3232190 108 17750 3160358 0.56 3178108 109 17234 3089559 0.55 3106793 110 16718 3015549 0.55 3032267 111 16410 2985205 0.55 3001615 112 16225 2935619 0.55 2951844 113 15626 2864808 0.54 2880434 114 15617 2798812 0.55 2814429 115 15160 2759124 0.55 2774284 116 14835 2685922 0.55 2700757 117 14484 2623036 0.55 2637520 118 14067 2566136 0.55 2580203 119 13831 2514258 0.55 2528089 120 13464 2470028 0.54 2483492 121 13430 2401825 0.56 2415255 122 12718 2356058 0.54 2368776 123 12575 2310352 0.54 2322927 124 12241 2251627 0.54 2263868 125 11977 2195785 0.54 2207762 126 11850 2151036 0.55 2162886 127 11425 2101712 0.54 2113137 128 11095 2050391 0.54 2061486 129 10667 2002448 0.53 2013115 130 10593 1953947 0.54 1964540 131 10347 1917155 0.54 1927502 132 10018 1872948 0.53 1882966 133 9916 1826043 0.54 1835959 134 9531 1781409 0.53 1790940 135 9453 1739567 0.54 1749020 136 9078 1699123 0.53 1708201 137 8825 1659146 0.53 1667971 138 8881 1614878 0.55 1623759 139 8515 1574486 0.54 1583001 140 8280 1539884 0.53 1548164 141 8070 1504205 0.53 1512275 142 7993 1469440 0.54 1477433 143 7974 1438827 0.55 1446801 144 7602 1402714 0.54 1410316 145 7425 1360861 0.54 1368286 146 7019 1327589 0.53 1334608 147 6902 1290883 0.53 1297785 148 6861 1259006 0.54 1265867 149 6647 1228806 0.54 1235453 150 6333 1197749 0.53 1204082 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 296667 22906267 1.28 23202934 2 167540 25065976 0.66 25233516 3 154872 25757764 0.60 25912636 4 147266 25885592 0.57 26032858 5 131147 24210143 0.54 24341290 6 127348 24037362 0.53 24164710 7 128327 24903300 0.51 25031627 8 120692 23769555 0.51 23890247 9 123573 24169945 0.51 24293518 10 122218 24235634 0.50 24357852 11 121315 24307525 0.50 24428840 12 121261 24216928 0.50 24338189 13 119068 23907645 0.50 24026713 14 119621 24015163 0.50 24134784 15 119017 23972580 0.49 24091597 16 119695 24046724 0.50 24166419 17 118940 24063007 0.49 24181947 18 118516 23985087 0.49 24103603 19 118593 23975570 0.49 24094163 20 117975 23969398 0.49 24087373 21 117747 23947129 0.49 24064876 22 116938 23887297 0.49 24004235 23 117073 23854232 0.49 23971305 24 116228 23863039 0.48 23979267 25 115985 23703885 0.49 23819870 26 115768 23548913 0.49 23664681 27 116133 23724722 0.49 23840855 28 115243 23564159 0.49 23679402 29 114867 23497556 0.49 23612423 30 113680 23297036 0.49 23410716 31 114302 23323184 0.49 23437486 32 113628 23239364 0.49 23352992 33 113121 23264347 0.48 23377468 34 112091 22941943 0.49 23054034 35 111355 22791309 0.49 22902664 36 111290 22684984 0.49 22796274 37 109730 22512334 0.49 22622064 38 109608 22396411 0.49 22506019 39 109305 22193584 0.49 22302889 40 108951 22104333 0.49 22213284 41 108468 22162684 0.49 22271152 42 106659 21886494 0.48 21993153 43 106094 21726080 0.49 21832174 44 105070 21496432 0.49 21601502 45 104161 21305710 0.49 21409871 46 103414 21234763 0.48 21338177 47 102532 21056631 0.48 21159163 48 101979 20913041 0.49 21015020 49 100873 20763997 0.48 20864870 50 99903 20537158 0.48 20637061 51 98857 20354360 0.48 20453217 52 98029 20273383 0.48 20371412 53 97092 20035776 0.48 20132868 54 96234 19876825 0.48 19973059 55 96528 19721291 0.49 19817819 56 94803 19576209 0.48 19671012 57 94289 19436349 0.48 19530638 58 93260 19189849 0.48 19283109 59 92279 19043496 0.48 19135775 60 91432 18795785 0.48 18887217 61 89796 18556067 0.48 18645863 62 88832 18435979 0.48 18524811 63 87959 18212528 0.48 18300487 64 87370 18030592 0.48 18117962 65 86318 17951304 0.48 18037622 66 85995 17671841 0.48 17757836 67 84326 17507440 0.48 17591766 68 83153 17277027 0.48 17360180 69 82146 17049169 0.48 17131315 70 82331 16956909 0.48 17039240 71 81263 16769105 0.48 16850368 72 80352 16574587 0.48 16654939 73 79580 16413002 0.48 16492582 74 77465 16130339 0.48 16207804 75 76595 15953569 0.48 16030164 76 75341 15719954 0.48 15795295 77 74759 15502208 0.48 15576967 78 73921 15321109 0.48 15395030 79 73354 15150846 0.48 15224200 80 71487 14914700 0.48 14986187 81 70921 14762403 0.48 14833324 82 69945 14487198 0.48 14557143 83 68593 14295866 0.48 14364459 84 67889 14108241 0.48 14176130 85 66239 13849436 0.48 13915675 86 66027 13607464 0.48 13673491 87 64764 13413560 0.48 13478324 88 63418 13233566 0.48 13296984 89 62713 13041536 0.48 13104249 90 61296 12802551 0.48 12863847 91 59747 12555189 0.47 12614936 92 59173 12383244 0.48 12442417 93 58060 12151764 0.48 12209824 94 57533 11992581 0.48 12050114 95 56083 11766693 0.47 11822776 96 55247 11594353 0.47 11649600 97 54709 11413311 0.48 11468020 98 53587 11198843 0.48 11252430 99 52859 11020048 0.48 11072907 100 51935 10856758 0.48 10908693 101 51444 10642123 0.48 10693567 102 50217 10445589 0.48 10495806 103 49303 10283749 0.48 10333052 104 48585 10091619 0.48 10140204 105 47430 9922141 0.48 9969571 106 46475 9727034 0.48 9773509 107 45323 9535063 0.47 9580386 108 45094 9371792 0.48 9416886 109 44200 9190992 0.48 9235192 110 43178 9011840 0.48 9055018 111 42171 8848225 0.47 8890396 112 41269 8688295 0.47 8729564 113 41044 8528539 0.48 8569583 114 39642 8338313 0.47 8377955 115 39050 8160467 0.48 8199517 116 38177 7993397 0.48 8031574 117 37606 7822870 0.48 7860476 118 36712 7664372 0.48 7701084 119 36107 7499773 0.48 7535880 120 35202 7329986 0.48 7365188 121 34418 7184339 0.48 7218757 122 33665 7016867 0.48 7050532 123 33140 6859169 0.48 6892309 124 32035 6713929 0.47 6745964 125 32070 6557385 0.49 6589455 126 30803 6389451 0.48 6420254 127 30224 6254193 0.48 6284417 128 29327 6108257 0.48 6137584 129 28748 5965394 0.48 5994142 130 28058 5837239 0.48 5865297 131 27578 5688843 0.48 5716421 132 27011 5565814 0.48 5592825 133 26459 5439356 0.48 5465815 134 25473 5310544 0.48 5336017 135 24830 5181499 0.48 5206329 136 24175 5047334 0.48 5071509 137 23781 4934835 0.48 4958616 138 23090 4821186 0.48 4844276 139 22709 4700412 0.48 4723121 140 22321 4582355 0.48 4604676 141 21585 4471001 0.48 4492586 142 20840 4369060 0.47 4389900 143 20537 4272144 0.48 4292681 144 20289 4172154 0.48 4192443 145 19530 4064615 0.48 4084145 146 19149 3957843 0.48 3976992 147 18529 3851096 0.48 3869625 148 18192 3755290 0.48 3773482 149 17692 3669045 0.48 3686737 150 17215 3579175 0.48 3596390