CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1529893 732805 67.61 2262698 2 1064703 448511 70.36 1513214 3 1365705 682785 66.67 2048490 4 1446243 756318 65.66 2202561 5 1520689 749779 66.98 2270468 6 1555612 769272 66.91 2324884 7 1422939 698676 67.07 2121615 8 1544404 741004 67.58 2285408 9 1495307 734044 67.07 2229351 10 1452552 725943 66.68 2178495 11 1439540 723367 66.56 2162907 12 1448575 738040 66.25 2186615 13 1465023 727327 66.82 2192350 14 1462222 749664 66.11 2211886 15 1466186 729947 66.76 2196133 16 1497675 760633 66.32 2258308 17 1499184 741328 66.91 2240512 18 1473112 735972 66.68 2209084 19 1459709 746200 66.17 2205909 20 1505991 743534 66.95 2249525 21 1521753 747553 67.06 2269306 22 1510296 747477 66.89 2257773 23 1518041 748698 66.97 2266739 24 1490671 762799 66.15 2253470 25 1527619 758205 66.83 2285824 26 1476739 768689 65.77 2245428 27 1470985 766001 65.76 2236986 28 1522336 754750 66.85 2277086 29 1508517 757288 66.58 2265805 30 1556767 765559 67.03 2322326 31 1528900 777435 66.29 2306335 32 1574688 768571 67.20 2343259 33 1507571 770072 66.19 2277643 34 1490513 762589 66.15 2253102 35 1526915 761924 66.71 2288839 36 1541269 770115 66.68 2311384 37 1544371 764041 66.90 2308412 38 1575096 780110 66.88 2355206 39 1543008 774781 66.57 2317789 40 1573319 768114 67.19 2341433 41 1542437 765944 66.82 2308381 42 1535919 762602 66.82 2298521 43 1564759 767402 67.09 2332161 44 1578496 768660 67.25 2347156 45 1580494 771286 67.20 2351780 46 1545665 780261 66.45 2325926 47 1541589 764429 66.85 2306018 48 1542186 783901 66.30 2326087 49 1573656 773284 67.05 2346940 50 1569944 771998 67.04 2341942 51 1559748 761044 67.21 2320792 52 1569503 765988 67.20 2335491 53 1579782 768312 67.28 2348094 54 1598166 789492 66.93 2387658 55 1563833 784144 66.60 2347977 56 1578868 768672 67.26 2347540 57 1577645 768452 67.25 2346097 58 1572826 778116 66.90 2350942 59 1591653 773046 67.31 2364699 60 1604553 772865 67.49 2377418 61 1588264 780320 67.06 2368584 62 1620164 775722 67.62 2395886 63 1607652 772074 67.56 2379726 64 1591186 779904 67.11 2371090 65 1586828 768516 67.37 2355344 66 1581743 765961 67.37 2347704 67 1590198 770182 67.37 2360380 68 1607543 773055 67.53 2380598 69 1606779 774350 67.48 2381129 70 1626041 776957 67.67 2402998 71 1604646 772361 67.51 2377007 72 1600868 771812 67.47 2372680 73 1600872 774181 67.40 2375053 74 1599306 769759 67.51 2369065 75 1600487 783673 67.13 2384160 76 1614924 774801 67.58 2389725 77 1603438 773000 67.47 2376438 78 1594380 782313 67.08 2376693 79 1599657 772579 67.43 2372236 80 1617627 772521 67.68 2390148 81 1598683 778034 67.26 2376717 82 1600788 782674 67.16 2383462 83 1616460 773111 67.65 2389571 84 1607674 784183 67.21 2391857 85 1602807 786204 67.09 2389011 86 1620883 776190 67.62 2397073 87 1614427 771458 67.67 2385885 88 1619816 776182 67.61 2395998 89 1624947 775212 67.70 2400159 90 1620537 775270 67.64 2395807 91 1603227 780251 67.26 2383478 92 1629449 776936 67.71 2406385 93 1628297 774057 67.78 2402354 94 1637694 787039 67.54 2424733 95 1633106 777536 67.75 2410642 96 1622269 782948 67.45 2405217 97 1621152 779586 67.53 2400738 98 1605298 784746 67.17 2390044 99 1638084 785418 67.59 2423502 100 1630770 781837 67.59 2412607 101 1629613 779070 67.66 2408683 102 1630190 786125 67.47 2416315 103 1620856 789318 67.25 2410174 104 1611994 790056 67.11 2402050 105 1640083 792669 67.42 2432752 106 1639700 779405 67.78 2419105 107 1633239 788147 67.45 2421386 108 1631803 780931 67.63 2412734 109 1616268 786747 67.26 2403015 110 1610887 780123 67.37 2391010 111 1627608 781106 67.57 2408714 112 1619152 781851 67.44 2401003 113 1609829 779928 67.36 2389757 114 1629588 785613 67.47 2415201 115 1624933 782490 67.50 2407423 116 1628861 786207 67.45 2415068 117 1642667 790802 67.50 2433469 118 1639849 786450 67.59 2426299 119 1621435 787300 67.31 2408735 120 1620341 788896 67.26 2409237 121 1625407 783422 67.48 2408829 122 1636213 784744 67.59 2420957 123 1628435 785993 67.45 2414428 124 1620490 791033 67.20 2411523 125 1634659 790899 67.39 2425558 126 1649535 791119 67.59 2440654 127 1648687 790871 67.58 2439558 128 1643322 790770 67.51 2434092 129 1640186 796248 67.32 2436434 130 1632955 788874 67.43 2421829 131 1634867 790162 67.42 2425029 132 1636207 792555 67.37 2428762 133 1633005 792326 67.33 2425331 134 1641977 795142 67.37 2437119 135 1626644 794900 67.17 2421544 136 1612379 793057 67.03 2405436 137 1604485 796847 66.82 2401332 138 1617520 795750 67.03 2413270 139 1617172 799488 66.92 2416660 140 1607363 798183 66.82 2405546 141 1593709 798050 66.63 2391759 142 1602161 797281 66.77 2399442 143 1590347 798933 66.56 2389280 144 1586144 802553 66.40 2388697 145 1580154 806242 66.22 2386396 146 1573733 810152 66.02 2383885 147 1566244 809234 65.93 2375478 148 1555024 811319 65.71 2366343 149 1523968 815762 65.13 2339730 150 1561926 819601 65.59 2381527 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 130763 7819538 1.64 7950301 2 56037 6244276 0.89 6300313 3 57763 7711788 0.74 7769551 4 55029 8258892 0.66 8313921 5 49791 8280460 0.60 8330251 6 48407 8081793 0.60 8130200 7 48431 8202529 0.59 8250960 8 47817 8188240 0.58 8236057 9 46955 8003925 0.58 8050880 10 46594 8005821 0.58 8052415 11 44694 7989990 0.56 8034684 12 47639 8111591 0.58 8159230 13 47141 8198232 0.57 8245373 14 46811 8112450 0.57 8159261 15 47350 8247703 0.57 8295053 16 46398 8177319 0.56 8223717 17 45088 8148451 0.55 8193539 18 47350 8237156 0.57 8284506 19 48106 8266321 0.58 8314427 20 47125 8237474 0.57 8284599 21 45954 8271606 0.55 8317560 22 47007 8275993 0.56 8323000 23 47365 8256273 0.57 8303638 24 48484 8479328 0.57 8527812 25 47411 8328490 0.57 8375901 26 47969 8240469 0.58 8288438 27 51644 8314664 0.62 8366308 28 47587 8406481 0.56 8454068 29 47134 8484360 0.55 8531494 30 47678 8404502 0.56 8452180 31 47723 8335396 0.57 8383119 32 47569 8385276 0.56 8432845 33 48910 8396805 0.58 8445715 34 47925 8333378 0.57 8381303 35 46360 8368387 0.55 8414747 36 48623 8360361 0.58 8408984 37 47100 8488282 0.55 8535382 38 49153 8508758 0.57 8557911 39 49869 8395435 0.59 8445304 40 47669 8384386 0.57 8432055 41 48783 8352121 0.58 8400904 42 46586 8413119 0.55 8459705 43 47041 8460574 0.55 8507615 44 47465 8438593 0.56 8486058 45 48182 8482112 0.56 8530294 46 48476 8416614 0.57 8465090 47 47045 8460907 0.55 8507952 48 50145 8506470 0.59 8556615 49 46142 8454403 0.54 8500545 50 47386 8452815 0.56 8500201 51 46806 8410582 0.55 8457388 52 47021 8392812 0.56 8439833 53 46707 8476874 0.55 8523581 54 48607 8497797 0.57 8546404 55 49335 8443886 0.58 8493221 56 45409 8458124 0.53 8503533 57 46884 8445418 0.55 8492302 58 48049 8438183 0.57 8486232 59 46633 8441352 0.55 8487985 60 46729 8459398 0.55 8506127 61 48289 8488017 0.57 8536306 62 47151 8528967 0.55 8576118 63 46782 8490266 0.55 8537048 64 48977 8433488 0.58 8482465 65 46804 8409202 0.55 8456006 66 47480 8446061 0.56 8493541 67 47481 8510431 0.55 8557912 68 47733 8527959 0.56 8575692 69 47667 8519180 0.56 8566847 70 47582 8447844 0.56 8495426 71 47046 8412730 0.56 8459776 72 47636 8490468 0.56 8538104 73 47369 8470221 0.56 8517590 74 47509 8467233 0.56 8514742 75 48141 8469275 0.57 8517416 76 46451 8492546 0.54 8538997 77 46223 8500034 0.54 8546257 78 48922 8529185 0.57 8578107 79 46150 8472456 0.54 8518606 80 47027 8520970 0.55 8567997 81 47389 8502721 0.55 8550110 82 49976 8516685 0.58 8566661 83 47328 8496777 0.55 8544105 84 48109 8493472 0.56 8541581 85 49901 8554340 0.58 8604241 86 46634 8569185 0.54 8615819 87 47835 8551703 0.56 8599538 88 46989 8529974 0.55 8576963 89 47487 8523013 0.55 8570500 90 47535 8514514 0.56 8562049 91 48153 8561842 0.56 8609995 92 46546 8554703 0.54 8601249 93 47903 8542744 0.56 8590647 94 47710 8511771 0.56 8559481 95 47191 8519401 0.55 8566592 96 47374 8528467 0.55 8575841 97 46640 8520068 0.54 8566708 98 49093 8536602 0.57 8585695 99 46361 8538260 0.54 8584621 100 46722 8531377 0.54 8578099 101 47437 8567475 0.55 8614912 102 47799 8548514 0.56 8596313 103 49058 8528194 0.57 8577252 104 49639 8535863 0.58 8585502 105 45733 8553284 0.53 8599017 106 47711 8545912 0.56 8593623 107 48166 8543314 0.56 8591480 108 46856 8538587 0.55 8585443 109 47190 8601237 0.55 8648427 110 46025 8590346 0.53 8636371 111 47301 8560698 0.55 8607999 112 46346 8575681 0.54 8622027 113 46874 8619440 0.54 8666314 114 46800 8575601 0.54 8622401 115 46495 8554048 0.54 8600543 116 46813 8554217 0.54 8601030 117 46608 8583610 0.54 8630218 118 47138 8564738 0.55 8611876 119 46983 8548745 0.55 8595728 120 47369 8559871 0.55 8607240 121 46646 8581911 0.54 8628557 122 47386 8568151 0.55 8615537 123 46875 8537702 0.55 8584577 124 47324 8559451 0.55 8606775 125 46843 8574976 0.54 8621819 126 46786 8556374 0.54 8603160 127 47011 8543370 0.55 8590381 128 46917 8540060 0.55 8586977 129 46119 8552045 0.54 8598164 130 46806 8530700 0.55 8577506 131 46640 8534294 0.54 8580934 132 47458 8555527 0.55 8602985 133 47274 8583443 0.55 8630717 134 47652 8593494 0.55 8641146 135 47678 8558357 0.55 8606035 136 47433 8517075 0.55 8564508 137 46532 8518939 0.54 8565471 138 46637 8525342 0.54 8571979 139 46819 8543478 0.55 8590297 140 46530 8557210 0.54 8603740 141 46711 8564999 0.54 8611710 142 46954 8542789 0.55 8589743 143 46975 8529316 0.55 8576291 144 47369 8500570 0.55 8547939 145 47521 8512317 0.56 8559838 146 47482 8497601 0.56 8545083 147 47369 8483161 0.56 8530530 148 47484 8466008 0.56 8513492 149 47263 8471523 0.55 8518786 150 80878 8423622 0.95 8504500 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 369703 24900658 1.46 25270361 2 179785 21502793 0.83 21682578 3 179431 25300393 0.70 25479824 4 166204 26239377 0.63 26405581 5 144185 25587414 0.56 25731599 6 142210 25833317 0.55 25975527 7 136790 25243894 0.54 25380684 8 138453 25472224 0.54 25610677 9 135594 25171503 0.54 25307097 10 135968 25233112 0.54 25369080 11 130116 25238326 0.51 25368442 12 139148 25330549 0.55 25469697 13 135092 25290286 0.53 25425378 14 135836 25488802 0.53 25624638 15 136457 25426595 0.53 25563052 16 134505 25424012 0.53 25558517 17 129484 25540527 0.50 25670011 18 135154 25683627 0.52 25818781 19 136828 25660757 0.53 25797585 20 133615 25522778 0.52 25656393 21 130634 25447687 0.51 25578321 22 132955 25685939 0.51 25818894 23 134573 25692174 0.52 25826747 24 133817 25565011 0.52 25698828 25 133954 25578406 0.52 25712360 26 138284 25633345 0.54 25771629 27 144839 25764874 0.56 25909713 28 132765 25760625 0.51 25893390 29 129849 25516481 0.51 25646330 30 133999 25593828 0.52 25727827 31 135352 25624860 0.53 25760212 32 133266 25663681 0.52 25796947 33 136763 25676060 0.53 25812823 34 136067 25639533 0.53 25775600 35 132887 25871007 0.51 26003894 36 136180 25809376 0.52 25945556 37 130751 25734321 0.51 25865072 38 135506 25723221 0.52 25858727 39 138697 25727460 0.54 25866157 40 133948 25633434 0.52 25767382 41 136310 25663843 0.53 25800153 42 129893 25722144 0.50 25852037 43 130915 25658700 0.51 25789615 44 131593 25711592 0.51 25843185 45 134061 25682463 0.52 25816524 46 132925 25644078 0.52 25777003 47 130119 25670313 0.50 25800432 48 137332 25733246 0.53 25870578 49 128047 25685349 0.50 25813396 50 129187 25608415 0.50 25737602 51 129658 25626397 0.50 25756055 52 131409 25620989 0.51 25752398 53 129377 25609418 0.50 25738795 54 133051 25608716 0.52 25741767 55 136649 25556656 0.53 25693305 56 126002 25581811 0.49 25707813 57 128341 25623687 0.50 25752028 58 132450 25644290 0.51 25776740 59 129384 25681022 0.50 25810406 60 130759 25793855 0.50 25924614 61 132280 25668132 0.51 25800412 62 129234 25659013 0.50 25788247 63 129025 25654058 0.50 25783083 64 134175 25628243 0.52 25762418 65 129896 25648725 0.50 25778621 66 131492 25767762 0.51 25899254 67 129313 25784575 0.50 25913888 68 129999 25683089 0.50 25813088 69 129509 25642570 0.50 25772079 70 130883 25576878 0.51 25707761 71 128601 25643556 0.50 25772157 72 129366 25623654 0.50 25753020 73 129898 25609842 0.50 25739740 74 129568 25576287 0.50 25705855 75 131893 25575859 0.51 25707752 76 127506 25571430 0.50 25698936 77 126973 25521471 0.50 25648444 78 131514 25447393 0.51 25578907 79 126450 25450184 0.49 25576634 80 128128 25545085 0.50 25673213 81 127686 25452439 0.50 25580125 82 134619 25423434 0.53 25558053 83 129566 25422142 0.51 25551708 84 131678 25473511 0.51 25605189 85 135707 25584442 0.53 25720149 86 125465 25570767 0.49 25696232 87 129040 25518103 0.50 25647143 88 128161 25549433 0.50 25677594 89 129532 25533416 0.50 25662948 90 130593 25605145 0.51 25735738 91 131199 25605288 0.51 25736487 92 127401 25571312 0.50 25698713 93 129889 25545974 0.51 25675863 94 130555 25604613 0.51 25735168 95 128522 25610577 0.50 25739099 96 127782 25655577 0.50 25783359 97 127429 25642273 0.49 25769702 98 132027 25661355 0.51 25793382 99 125939 25634374 0.49 25760313 100 127756 25566158 0.50 25693914 101 129000 25537664 0.50 25666664 102 131541 25559102 0.51 25690643 103 133781 25548599 0.52 25682380 104 135400 25616883 0.53 25752283 105 124895 25530587 0.49 25655482 106 129617 25517219 0.51 25646836 107 130707 25564949 0.51 25695656 108 128615 25562116 0.50 25690731 109 127194 25564498 0.50 25691692 110 125711 25535851 0.49 25661562 111 128703 25499641 0.50 25628344 112 126635 25545704 0.49 25672339 113 126925 25492535 0.50 25619460 114 127083 25494428 0.50 25621511 115 127125 25520458 0.50 25647583 116 127709 25572425 0.50 25700134 117 125589 25593208 0.49 25718797 118 127299 25556938 0.50 25684237 119 128173 25551703 0.50 25679876 120 128994 25572781 0.50 25701775 121 127577 25587770 0.50 25715347 122 129075 25547224 0.50 25676299 123 128949 25574735 0.50 25703684 124 127580 25598323 0.50 25725903 125 126851 25587269 0.49 25714120 126 128919 25586636 0.50 25715555 127 129067 25572484 0.50 25701551 128 128430 25578559 0.50 25706989 129 127791 25634792 0.50 25762583 130 128684 25627374 0.50 25756058 131 129058 25631786 0.50 25760844 132 129313 25629598 0.50 25758911 133 129813 25598960 0.50 25728773 134 129451 25603087 0.50 25732538 135 129297 25575686 0.50 25704983 136 128870 25562521 0.50 25691391 137 126331 25569409 0.49 25695740 138 128094 25584378 0.50 25712472 139 127792 25613108 0.50 25740900 140 126978 25588083 0.49 25715061 141 127519 25547626 0.50 25675145 142 128573 25526523 0.50 25655096 143 128528 25474277 0.50 25602805 144 129133 25466207 0.50 25595340 145 129131 25469024 0.50 25598155 146 129315 25417589 0.51 25546904 147 129158 25369313 0.51 25498471 148 128283 25266929 0.51 25395212 149 128204 25254557 0.51 25382761 150 219541 25140915 0.87 25360456 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 57322 3781808 1.49 3839130 2 47494 2245574 2.07 2293068 3 579162 1061924 35.29 1641086 4 1049018 1066228 49.59 2115246 5 1255983 973815 56.33 2229798 6 1322119 927653 58.77 2249772 7 1411391 934491 60.16 2345882 8 1273591 833276 60.45 2106867 9 1410080 852532 62.32 2262612 10 1354461 825682 62.13 2180143 11 1318440 788598 62.57 2107038 12 1338299 776780 63.27 2115079 13 1341052 759376 63.85 2100428 14 1347483 748850 64.28 2096333 15 1382652 750827 64.81 2133479 16 1349651 736977 64.68 2086628 17 1381712 728986 65.46 2110698 18 1368263 719148 65.55 2087411 19 1335936 705432 65.44 2041368 20 1336408 703912 65.50 2040320 21 1353595 701421 65.87 2055016 22 1348406 692454 66.07 2040860 23 1341746 687887 66.11 2029633 24 1335478 680806 66.23 2016284 25 1330502 678508 66.23 2009010 26 1326864 671388 66.40 1998252 27 1294986 664124 66.10 1959110 28 1270722 654092 66.02 1924814 29 1284766 647599 66.49 1932365 30 1270337 644045 66.36 1914382 31 1287278 643332 66.68 1930610 32 1273214 634900 66.73 1908114 33 1279819 631270 66.97 1911089 34 1227870 615159 66.62 1843029 35 1207149 606452 66.56 1813601 36 1217518 608215 66.69 1825733 37 1210766 598916 66.90 1809682 38 1205445 596021 66.91 1801466 39 1232250 592284 67.54 1824534 40 1184833 579670 67.15 1764503 41 1189353 575692 67.38 1765045 42 1164810 567497 67.24 1732307 43 1141925 555669 67.27 1697594 44 1137846 551562 67.35 1689408 45 1135080 545960 67.52 1681040 46 1113961 536791 67.48 1650752 47 1119976 535532 67.65 1655508 48 1081683 520447 67.52 1602130 49 1066571 512502 67.54 1579073 50 1056206 511055 67.39 1567261 51 1043702 502360 67.51 1546062 52 1026214 493807 67.51 1520021 53 1005637 483697 67.52 1489334 54 991858 475987 67.57 1467845 55 995120 473873 67.74 1468993 56 967744 463513 67.61 1431257 57 956692 455595 67.74 1412287 58 936472 446668 67.71 1383140 59 927328 440500 67.80 1367828 60 906818 433857 67.64 1340675 61 897765 428633 67.68 1326398 62 890363 421351 67.88 1311714 63 879972 416153 67.89 1296125 64 867150 407634 68.02 1274784 65 840811 399748 67.78 1240559 66 824088 392608 67.73 1216696 67 805498 385938 67.61 1191436 68 804289 380052 67.91 1184341 69 793035 373839 67.96 1166874 70 778220 369156 67.83 1147376 71 778209 364616 68.10 1142825 72 751943 354363 67.97 1106306 73 737024 347640 67.95 1084664 74 724549 342318 67.91 1066867 75 704975 335520 67.75 1040495 76 695560 329752 67.84 1025312 77 685797 324444 67.88 1010241 78 667620 316116 67.87 983736 79 663600 312083 68.01 975683 80 645872 305458 67.89 951330 81 630996 299706 67.80 930702 82 620561 294838 67.79 915399 83 613331 289954 67.90 903285 84 598542 283068 67.89 881610 85 587068 277919 67.87 864987 86 572835 272759 67.74 845594 87 568442 267059 68.04 835501 88 549385 260489 67.84 809874 89 541656 257341 67.79 798997 90 528084 251336 67.75 779420 91 513552 245565 67.65 759117 92 505061 240008 67.79 745069 93 492997 235168 67.70 728165 94 483677 229916 67.78 713593 95 480416 227322 67.88 707738 96 466263 220635 67.88 686898 97 453305 214894 67.84 668199 98 443817 211890 67.69 655707 99 432285 207276 67.59 639561 100 424731 203063 67.65 627794 101 412698 199718 67.39 612416 102 404503 194929 67.48 599432 103 399264 191230 67.62 590494 104 389115 185623 67.70 574738 105 377084 182375 67.40 559459 106 373024 178868 67.59 551892 107 365186 174959 67.61 540145 108 358017 170826 67.70 528843 109 346178 166522 67.52 512700 110 339065 163447 67.47 502512 111 333250 159014 67.70 492264 112 324112 157180 67.34 481292 113 313249 152513 67.26 465762 114 306613 148039 67.44 454652 115 303735 145983 67.54 449718 116 293762 142933 67.27 436695 117 289070 139142 67.51 428212 118 285533 135489 67.82 421022 119 278247 133542 67.57 411789 120 270989 131198 67.38 402187 121 264731 127081 67.57 391812 122 260622 125011 67.58 385633 123 255549 121451 67.78 377000 124 247482 119180 67.50 366662 125 242719 116482 67.57 359201 126 236601 114053 67.47 350654 127 237192 112291 67.87 349483 128 229411 109918 67.61 339329 129 223559 106425 67.75 329984 130 218888 103935 67.80 322823 131 214601 102057 67.77 316658 132 208815 99915 67.64 308730 133 204336 97835 67.62 302171 134 198460 95239 67.57 293699 135 193854 93026 67.57 286880 136 187599 90724 67.40 278323 137 181699 88842 67.16 270541 138 177267 86642 67.17 263909 139 174365 84596 67.33 258961 140 168876 82656 67.14 251532 141 164219 80693 67.05 244912 142 159408 79396 66.75 238804 143 156227 76900 67.01 233127 144 152159 75625 66.80 227784 145 146794 73448 66.65 220242 146 143359 71634 66.68 214993 147 138754 69466 66.64 208220 148 136812 68788 66.54 205600 149 132340 66814 66.45 199154 150 128888 65006 66.47 193894 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 102912 7327846 1.38 7430758 2 74362 9986611 0.74 10060973 3 52411 8232284 0.63 8284695 4 39086 6353705 0.61 6392791 5 44923 7734339 0.58 7779262 6 46986 8263683 0.57 8310669 7 45268 8159337 0.55 8204605 8 44191 7924382 0.55 7968573 9 44464 8028697 0.55 8073161 10 43737 7984307 0.54 8028044 11 42149 7777864 0.54 7820013 12 41617 7698518 0.54 7740135 13 41053 7597838 0.54 7638891 14 42319 7762286 0.54 7804605 15 42520 7777509 0.54 7820029 16 41865 7690592 0.54 7732457 17 42476 7716346 0.55 7758822 18 41664 7594173 0.55 7635837 19 41356 7545237 0.55 7586593 20 42123 7563914 0.55 7606037 21 41379 7523629 0.55 7565008 22 40586 7447087 0.54 7487673 23 41101 7463389 0.55 7504490 24 40839 7385082 0.55 7425921 25 40314 7285392 0.55 7325706 26 41340 7455143 0.55 7496483 27 40147 7280896 0.55 7321043 28 39462 7180461 0.55 7219923 29 39291 7129239 0.55 7168530 30 39396 7086276 0.55 7125672 31 39727 7142756 0.55 7182483 32 38983 7014890 0.55 7053873 33 38040 6856903 0.55 6894943 34 37708 6838963 0.55 6876671 35 37264 6750275 0.55 6787539 36 36008 6598133 0.54 6634141 37 36328 6568045 0.55 6604373 38 35666 6481774 0.55 6517440 39 35805 6469999 0.55 6505804 40 35741 6493859 0.55 6529600 41 34643 6306244 0.55 6340887 42 34124 6204436 0.55 6238560 43 33695 6131877 0.55 6165572 44 33359 6084411 0.55 6117770 45 33169 6016319 0.55 6049488 46 32948 5977078 0.55 6010026 47 33004 5936227 0.55 5969231 48 32366 5830875 0.55 5863241 49 32121 5755762 0.55 5787883 50 31033 5719322 0.54 5750355 51 30939 5578891 0.55 5609830 52 30442 5534220 0.55 5564662 53 30423 5444818 0.56 5475241 54 29514 5326335 0.55 5355849 55 29997 5351280 0.56 5381277 56 28878 5274892 0.54 5303770 57 28862 5130530 0.56 5159392 58 28447 5079692 0.56 5108139 59 28186 5004606 0.56 5032792 60 27445 4901276 0.56 4928721 61 27267 4831180 0.56 4858447 62 26458 4745671 0.55 4772129 63 26302 4690339 0.56 4716641 64 26243 4640627 0.56 4666870 65 25581 4554687 0.56 4580268 66 24920 4440688 0.56 4465608 67 24397 4351963 0.56 4376360 68 24165 4272612 0.56 4296777 69 23779 4230874 0.56 4254653 70 23637 4188629 0.56 4212266 71 23608 4124305 0.57 4147913 72 22895 4030690 0.56 4053585 73 22536 3925307 0.57 3947843 74 22243 3876556 0.57 3898799 75 21656 3802010 0.57 3823666 76 21479 3741530 0.57 3763009 77 21077 3671439 0.57 3692516 78 20460 3599919 0.57 3620379 79 20274 3548421 0.57 3568695 80 19638 3493183 0.56 3512821 81 19431 3405056 0.57 3424487 82 18984 3358990 0.56 3377974 83 18692 3283141 0.57 3301833 84 18243 3232277 0.56 3250520 85 17773 3142632 0.56 3160405 86 17625 3082286 0.57 3099911 87 17330 3041530 0.57 3058860 88 17006 2992221 0.57 3009227 89 16379 2925826 0.56 2942205 90 16165 2871832 0.56 2887997 91 16026 2820079 0.57 2836105 92 15569 2745983 0.56 2761552 93 15396 2710552 0.56 2725948 94 15159 2665233 0.57 2680392 95 14598 2604688 0.56 2619286 96 14335 2556145 0.56 2570480 97 14283 2492189 0.57 2506472 98 13783 2438498 0.56 2452281 99 13397 2394541 0.56 2407938 100 13406 2354989 0.57 2368395 101 13063 2298635 0.57 2311698 102 12715 2251096 0.56 2263811 103 12495 2207809 0.56 2220304 104 12230 2156430 0.56 2168660 105 11942 2107596 0.56 2119538 106 11595 2059018 0.56 2070613 107 11524 2016484 0.57 2028008 108 11289 1976820 0.57 1988109 109 10865 1926703 0.56 1937568 110 10624 1883042 0.56 1893666 111 10420 1856032 0.56 1866452 112 10235 1819579 0.56 1829814 113 10101 1776790 0.57 1786891 114 9813 1730950 0.56 1740763 115 9633 1700759 0.56 1710392 116 9196 1657577 0.55 1666773 117 9037 1618808 0.56 1627845 118 8992 1577611 0.57 1586603 119 8649 1545990 0.56 1554639 120 8447 1514417 0.55 1522864 121 8210 1476323 0.55 1484533 122 7965 1443575 0.55 1451540 123 7931 1412805 0.56 1420736 124 7573 1380822 0.55 1388395 125 7493 1347414 0.55 1354907 126 7211 1314184 0.55 1321395 127 7050 1284739 0.55 1291789 128 6970 1255508 0.55 1262478 129 6732 1223766 0.55 1230498 130 6430 1193746 0.54 1200176 131 6406 1171520 0.54 1177926 132 6349 1145417 0.55 1151766 133 6292 1115974 0.56 1122266 134 6082 1089748 0.56 1095830 135 6008 1063567 0.56 1069575 136 5770 1040602 0.55 1046372 137 5519 1019463 0.54 1024982 138 5304 990378 0.53 995682 139 5357 969042 0.55 974399 140 5266 947813 0.55 953079 141 5085 924339 0.55 929424 142 4914 905280 0.54 910194 143 4859 886148 0.55 891007 144 4907 866467 0.56 871374 145 4578 843613 0.54 848191 146 4561 821138 0.55 825699 147 4363 801910 0.54 806273 148 4245 783848 0.54 788093 149 4246 766512 0.55 770758 150 4054 750198 0.54 754252 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 309261 22765320 1.34 23074581 2 172200 24724493 0.69 24896693 3 154667 25152317 0.61 25306984 4 146224 25190618 0.58 25336842 5 130139 23593230 0.55 23723369 6 125198 23414887 0.53 23540085 7 127406 24193814 0.52 24321220 8 118729 23070718 0.51 23189447 9 121612 23409441 0.52 23531053 10 120804 23411872 0.51 23532676 11 118684 23407340 0.50 23526024 12 119425 23272994 0.51 23392419 13 116014 22949384 0.50 23065398 14 116412 22975881 0.50 23092293 15 116705 22898188 0.51 23014893 16 116295 22901861 0.51 23018156 17 115544 22834712 0.50 22950256 18 114795 22698688 0.50 22813483 19 114012 22610465 0.50 22724477 20 113098 22539043 0.50 22652141 21 112805 22427249 0.50 22540054 22 112112 22318713 0.50 22430825 23 111043 22206252 0.50 22317295 24 110551 22142719 0.50 22253270 25 109443 21930824 0.50 22040267 26 108891 21695588 0.50 21804479 27 109306 21762718 0.50 21872024 28 107625 21538617 0.50 21646242 29 106165 21402763 0.49 21508928 30 105066 21131396 0.49 21236462 31 105112 21062421 0.50 21167533 32 103047 20877702 0.49 20980749 33 103202 20789237 0.49 20892439 34 101878 20451400 0.50 20553278 35 100904 20226226 0.50 20327130 36 99806 20039696 0.50 20139502 37 99065 19803025 0.50 19902090 38 97966 19603631 0.50 19701597 39 97085 19338818 0.50 19435903 40 95780 19174060 0.50 19269840 41 95447 19087466 0.50 19182913 42 93747 18779020 0.50 18872767 43 91943 18536051 0.49 18627994 44 90961 18260601 0.50 18351562 45 89821 18012177 0.50 18101998 46 89201 17843389 0.50 17932590 47 87699 17605203 0.50 17692902 48 86357 17394836 0.49 17481193 49 85361 17193856 0.49 17279217 50 83260 16917782 0.49 17001042 51 82702 16661833 0.49 16744535 52 81387 16488925 0.49 16570312 53 80087 16220711 0.49 16300798 54 79444 16008561 0.49 16088005 55 77947 15803902 0.49 15881849 56 77551 15610380 0.49 15687931 57 76383 15414192 0.49 15490575 58 74914 15130390 0.49 15205304 59 73724 14931328 0.49 15005052 60 72338 14663188 0.49 14735526 61 71497 14410579 0.49 14482076 62 70285 14233879 0.49 14304164 63 68939 13984962 0.49 14053901 64 67728 13779719 0.49 13847447 65 67260 13628560 0.49 13695820 66 66266 13352168 0.49 13418434 67 64739 13160092 0.49 13224831 68 63440 12922048 0.49 12985488 69 61973 12693366 0.49 12755339 70 62183 12552573 0.49 12614756 71 61013 12357464 0.49 12418477 72 60044 12149588 0.49 12209632 73 59150 11964301 0.49 12023451 74 57826 11712984 0.49 11770810 75 57133 11525451 0.49 11582584 76 55493 11316035 0.49 11371528 77 54816 11101773 0.49 11156589 78 53591 10917415 0.49 10971006 79 52980 10747060 0.49 10800040 80 51427 10543613 0.49 10595040 81 50682 10377519 0.49 10428201 82 49467 10148191 0.49 10197658 83 49055 9967553 0.49 10016608 84 48317 9799089 0.49 9847406 85 47303 9582332 0.49 9629635 86 46134 9379266 0.49 9425400 87 45160 9202794 0.49 9247954 88 44400 9038407 0.49 9082807 89 43707 8877471 0.49 8921178 90 42567 8685882 0.49 8728449 91 41255 8499279 0.48 8540534 92 40497 8342084 0.48 8382581 93 39601 8161231 0.48 8200832 94 39327 8028732 0.49 8068059 95 38545 7854724 0.49 7893269 96 37934 7706532 0.49 7744466 97 37349 7556984 0.49 7594333 98 36328 7403178 0.49 7439506 99 35517 7262232 0.49 7297749 100 34822 7129260 0.49 7164082 101 34014 6969813 0.49 7003827 102 33558 6822961 0.49 6856519 103 33284 6700043 0.49 6733327 104 32108 6559353 0.49 6591461 105 30914 6433352 0.48 6464266 106 30865 6294955 0.49 6325820 107 30049 6158846 0.49 6188895 108 29348 6044806 0.48 6074154 109 29139 5911190 0.49 5940329 110 28255 5779287 0.49 5807542 111 27747 5670350 0.49 5698097 112 27198 5556172 0.49 5583370 113 26777 5442046 0.49 5468823 114 25961 5314603 0.49 5340564 115 25110 5195048 0.48 5220158 116 24493 5081734 0.48 5106227 117 24199 4968422 0.48 4992621 118 23735 4856189 0.49 4879924 119 23124 4749579 0.48 4772703 120 22836 4642818 0.49 4665654 121 22257 4542425 0.49 4564682 122 21632 4438454 0.49 4460086 123 21081 4335310 0.48 4356391 124 20796 4237211 0.49 4258007 125 20015 4135974 0.48 4155989 126 19760 4032648 0.49 4052408 127 19433 3937781 0.49 3957214 128 19046 3849813 0.49 3868859 129 18265 3764181 0.48 3782446 130 17965 3678341 0.49 3696306 131 17477 3589023 0.48 3606500 132 17148 3510281 0.49 3527429 133 16940 3429440 0.49 3446380 134 16209 3348608 0.48 3364817 135 16251 3267061 0.49 3283312 136 15449 3191947 0.48 3207396 137 15124 3117925 0.48 3133049 138 15034 3048566 0.49 3063600 139 14640 2976467 0.49 2991107 140 13993 2908706 0.48 2922699 141 13822 2839927 0.48 2853749 142 13553 2779116 0.49 2792669 143 13349 2717179 0.49 2730528 144 13052 2656603 0.49 2669655 145 12816 2594027 0.49 2606843 146 12376 2531154 0.49 2543530 147 12259 2467180 0.49 2479439 148 11922 2410144 0.49 2422066 149 11366 2359776 0.48 2371142 150 11255 2307640 0.49 2318895