CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1901149 917735 67.44 2818884 2 1536380 693077 68.91 2229457 3 1859225 902776 67.31 2762001 4 1935233 960596 66.83 2895829 5 1971584 951038 67.46 2922622 6 2011875 970186 67.47 2982061 7 1890658 905889 67.61 2796547 8 1983788 935206 67.96 2918994 9 1932734 931379 67.48 2864113 10 1908744 925148 67.35 2833892 11 1874160 916094 67.17 2790254 12 1909199 933011 67.17 2842210 13 1914670 925265 67.42 2839935 14 1911356 940705 67.02 2852061 15 1906845 925903 67.31 2832748 16 1950373 949827 67.25 2900200 17 1919519 932868 67.30 2852387 18 1905491 929546 67.21 2835037 19 1892934 939871 66.82 2832805 20 1935833 938447 67.35 2874280 21 1933026 937488 67.34 2870514 22 1936184 940767 67.30 2876951 23 1939592 945166 67.24 2884758 24 1919287 957829 66.71 2877116 25 1944844 947898 67.23 2892742 26 1892276 958490 66.38 2850766 27 1894543 955720 66.47 2850263 28 1934940 946285 67.16 2881225 29 1916454 948042 66.90 2864496 30 1968340 959187 67.24 2927527 31 1942150 964408 66.82 2906558 32 1984143 959905 67.40 2944048 33 1910338 960398 66.55 2870736 34 1888118 948562 66.56 2836680 35 1926573 956787 66.82 2883360 36 1942343 954638 67.05 2896981 37 1946080 955302 67.07 2901382 38 1988593 962635 67.38 2951228 39 1942141 958319 66.96 2900460 40 1971947 962741 67.19 2934688 41 1950236 954168 67.15 2904404 42 1932709 950306 67.04 2883015 43 1960486 958558 67.16 2919044 44 1981248 961172 67.33 2942420 45 1986393 963514 67.34 2949907 46 1946551 964974 66.86 2911525 47 1953027 954403 67.17 2907430 48 1956216 967982 66.90 2924198 49 1977929 966739 67.17 2944668 50 1973718 961365 67.25 2935083 51 1961212 955579 67.24 2916791 52 1975756 957225 67.36 2932981 53 1979865 960504 67.33 2940369 54 2012332 975636 67.35 2987968 55 1973812 969624 67.06 2943436 56 1993296 963930 67.40 2957226 57 1982443 959115 67.39 2941558 58 1979827 965390 67.22 2945217 59 1995064 963742 67.43 2958806 60 2010481 965255 67.56 2975736 61 1995514 965772 67.39 2961286 62 2024518 967728 67.66 2992246 63 2010130 964401 67.58 2974531 64 1997954 970726 67.30 2968680 65 1988265 960312 67.43 2948577 66 1984389 959623 67.40 2944012 67 1992823 960009 67.49 2952832 68 2009823 965740 67.54 2975563 69 2011294 966335 67.55 2977629 70 2029204 968476 67.69 2997680 71 2008193 963105 67.59 2971298 72 2007168 965229 67.53 2972397 73 2002433 964384 67.49 2966817 74 2002952 962246 67.55 2965198 75 1999963 969294 67.36 2969257 76 2006418 962079 67.59 2968497 77 1996077 963275 67.45 2959352 78 2002940 968665 67.40 2971605 79 1992814 963168 67.42 2955982 80 2014566 962313 67.67 2976879 81 1993843 965378 67.38 2959221 82 1999779 967694 67.39 2967473 83 2012253 960376 67.69 2972629 84 2004170 972063 67.34 2976233 85 2003905 972035 67.34 2975940 86 1998632 966431 67.41 2965063 87 2016186 963138 67.67 2979324 88 2023645 968129 67.64 2991774 89 2027107 966789 67.71 2993896 90 2024750 970064 67.61 2994814 91 2010576 968094 67.50 2978670 92 2030387 967270 67.73 2997657 93 2033785 966503 67.79 3000288 94 2050125 976069 67.75 3026194 95 2038313 969308 67.77 3007621 96 2028572 970170 67.65 2998742 97 2024395 968782 67.63 2993177 98 2016074 973186 67.44 2989260 99 2044613 979268 67.62 3023881 100 2038347 974613 67.65 3012960 101 2046195 970258 67.83 3016453 102 2040003 972546 67.72 3012549 103 2031223 972293 67.63 3003516 104 2027213 975076 67.52 3002289 105 2040240 987549 67.38 3027789 106 2045358 969414 67.84 3014772 107 2038156 971250 67.73 3009406 108 2037379 970532 67.73 3007911 109 2018578 972580 67.48 2991158 110 1991195 970646 67.23 2961841 111 2029564 971969 67.62 3001533 112 2025913 968880 67.65 2994793 113 1996986 968432 67.34 2965418 114 2032430 972833 67.63 3005263 115 2027927 973067 67.58 3000994 116 2034441 976849 67.56 3011290 117 2038769 982226 67.49 3020995 118 2040105 979924 67.55 3020029 119 2019776 971965 67.51 2991741 120 2020959 974354 67.47 2995313 121 2005705 972190 67.35 2977895 122 2033479 972686 67.64 3006165 123 2028187 972330 67.59 3000517 124 2023956 976820 67.45 3000776 125 2034994 982465 67.44 3017459 126 2040409 978114 67.60 3018523 127 2050571 980687 67.65 3031258 128 2044121 980516 67.58 3024637 129 2045457 983484 67.53 3028941 130 2033183 978307 67.51 3011490 131 2041503 978969 67.59 3020472 132 2044220 978515 67.63 3022735 133 2045876 983010 67.55 3028886 134 2051816 985642 67.55 3037458 135 2038837 984373 67.44 3023210 136 2023691 982050 67.33 3005741 137 2020722 982907 67.28 3003629 138 2023935 984558 67.27 3008493 139 2036589 988743 67.32 3025332 140 2029743 989313 67.23 3019056 141 2007375 988295 67.01 2995670 142 2025067 989783 67.17 3014850 143 2015469 991730 67.02 3007199 144 2019180 995968 66.97 3015148 145 2009049 997147 66.83 3006196 146 2001847 1000497 66.68 3002344 147 1999946 1001434 66.63 3001380 148 1984382 1003875 66.41 2988257 149 1948304 1009147 65.88 2957451 150 1996796 1015366 66.29 3012162 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 173515 11012282 1.55 11185797 2 81940 9625970 0.84 9707910 3 79766 11071019 0.72 11150785 4 73839 11732469 0.63 11806308 5 68284 11853931 0.57 11922215 6 67124 11658174 0.57 11725298 7 67296 11685857 0.57 11753153 8 66800 11597979 0.57 11664779 9 64987 11429213 0.57 11494200 10 65817 11406224 0.57 11472041 11 62114 11378502 0.54 11440616 12 65514 11545599 0.56 11611113 13 65765 11632243 0.56 11698008 14 64169 11537817 0.55 11601986 15 64674 11683244 0.55 11747918 16 63680 11610608 0.55 11674288 17 62188 11588000 0.53 11650188 18 65256 11685568 0.56 11750824 19 65240 11739190 0.55 11804430 20 65030 11693594 0.55 11758624 21 63921 11718932 0.54 11782853 22 64779 11762460 0.55 11827239 23 65538 11737060 0.56 11802598 24 68197 11989664 0.57 12057861 25 65087 11807937 0.55 11873024 26 65072 11714682 0.55 11779754 27 68089 11773927 0.57 11842016 28 65539 11903786 0.55 11969325 29 64768 11973794 0.54 12038562 30 65533 11873636 0.55 11939169 31 65232 11848692 0.55 11913924 32 65001 11889773 0.54 11954774 33 65932 11918607 0.55 11984539 34 65647 11840824 0.55 11906471 35 65826 11857747 0.55 11923573 36 63355 11821279 0.53 11884634 37 69253 11986106 0.57 12055359 38 65928 12005920 0.55 12071848 39 64409 11907817 0.54 11972226 40 67174 11874739 0.56 11941913 41 63777 11832292 0.54 11896069 42 64719 11915396 0.54 11980115 43 65366 11972897 0.54 12038263 44 64923 11921321 0.54 11986244 45 66786 11953084 0.56 12019870 46 64556 11903614 0.54 11968170 47 64266 11945401 0.54 12009667 48 67136 11992742 0.56 12059878 49 63284 11946603 0.53 12009887 50 64513 11927019 0.54 11991532 51 64829 11874769 0.54 11939598 52 64941 11852306 0.54 11917247 53 63846 11965193 0.53 12029039 54 65254 11955327 0.54 12020581 55 66540 11951956 0.55 12018496 56 62341 11936434 0.52 11998775 57 64280 11921619 0.54 11985899 58 64334 11904724 0.54 11969058 59 62878 11905699 0.53 11968577 60 64645 11924457 0.54 11989102 61 64987 11971062 0.54 12036049 62 64740 12032988 0.54 12097728 63 64077 11980082 0.53 12044159 64 65923 11937626 0.55 12003549 65 63117 11869666 0.53 11932783 66 65183 11922737 0.54 11987920 67 64607 11992322 0.54 12056929 68 64799 12005467 0.54 12070266 69 64770 12008492 0.54 12073262 70 65321 11929194 0.54 11994515 71 63431 11926328 0.53 11989759 72 64453 11977964 0.54 12042417 73 65141 11957381 0.54 12022522 74 64974 11955123 0.54 12020097 75 64894 11958163 0.54 12023057 76 63720 11996610 0.53 12060330 77 63885 11996375 0.53 12060260 78 66269 12035998 0.55 12102267 79 63255 11968785 0.53 12032040 80 65025 12021393 0.54 12086418 81 64123 11989607 0.53 12053730 82 66136 12013052 0.55 12079188 83 64362 11993920 0.53 12058282 84 65436 11995690 0.54 12061126 85 66467 12045671 0.55 12112138 86 62002 12056944 0.51 12118946 87 64400 12047053 0.53 12111453 88 64158 12029836 0.53 12093994 89 64644 12013342 0.54 12077986 90 64514 11996533 0.53 12061047 91 64464 12045859 0.53 12110323 92 63519 12029400 0.53 12092919 93 64423 12023661 0.53 12088084 94 64868 11991367 0.54 12056235 95 63608 11996836 0.53 12060444 96 63443 12012188 0.53 12075631 97 62725 12001814 0.52 12064539 98 64997 12020311 0.54 12085308 99 61990 12010166 0.51 12072156 100 62444 12020946 0.52 12083390 101 64211 12045408 0.53 12109619 102 66871 12038314 0.55 12105185 103 67232 12015073 0.56 12082305 104 65791 12024099 0.54 12089890 105 61953 12028664 0.51 12090617 106 64241 12021928 0.53 12086169 107 64916 12014884 0.54 12079800 108 63809 12025325 0.53 12089134 109 63870 12089321 0.53 12153191 110 62563 12074229 0.52 12136792 111 64792 12038931 0.54 12103723 112 64346 12060929 0.53 12125275 113 63491 12097924 0.52 12161415 114 63693 12055678 0.53 12119371 115 63175 12045148 0.52 12108323 116 64274 12047204 0.53 12111478 117 62298 12055335 0.51 12117633 118 63599 12045892 0.53 12109491 119 65416 12041003 0.54 12106419 120 65291 12033921 0.54 12099212 121 63644 12068618 0.52 12132262 122 64934 12035790 0.54 12100724 123 63794 12019369 0.53 12083163 124 64058 12025220 0.53 12089278 125 63224 12045977 0.52 12109201 126 64113 12031945 0.53 12096058 127 64817 12024294 0.54 12089111 128 64700 12018358 0.54 12083058 129 65161 12026916 0.54 12092077 130 64723 12016948 0.54 12081671 131 64086 12019263 0.53 12083349 132 65390 12035982 0.54 12101372 133 65106 12069301 0.54 12134407 134 65315 12072630 0.54 12137945 135 64673 12023942 0.53 12088615 136 64691 11993183 0.54 12057874 137 64020 11992972 0.53 12056992 138 63767 12000972 0.53 12064739 139 63783 12011521 0.53 12075304 140 64886 12037590 0.54 12102476 141 63486 12028559 0.53 12092045 142 64285 12026272 0.53 12090557 143 64643 12014814 0.54 12079457 144 64672 11991617 0.54 12056289 145 65459 11995653 0.54 12061112 146 65255 11977220 0.54 12042475 147 65624 11958747 0.55 12024371 148 65438 11949394 0.54 12014832 149 65272 11952581 0.54 12017853 150 101000 11917034 0.84 12018034 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 505978 35694062 1.40 36200040 2 263480 32540388 0.80 32803868 3 255934 36921831 0.69 37177765 4 232854 38514585 0.60 38747439 5 207007 38066378 0.54 38273385 6 205055 38399658 0.53 38604713 7 201738 37729249 0.53 37930987 8 206263 37938967 0.54 38145230 9 200167 37670250 0.53 37870417 10 205186 37680396 0.54 37885582 11 192058 37685426 0.51 37877484 12 200670 37887330 0.53 38088000 13 199225 37844748 0.52 38043973 14 197373 38080009 0.52 38277382 15 198566 38075486 0.52 38274052 16 195285 38123398 0.51 38318683 17 190813 38253251 0.50 38444064 18 198937 38465178 0.51 38664115 19 196306 38393286 0.51 38589592 20 195153 38182173 0.51 38377326 21 192112 38183436 0.50 38375548 22 195181 38448841 0.51 38644022 23 199373 38421746 0.52 38621119 24 200594 38286633 0.52 38487227 25 194921 38262933 0.51 38457854 26 198126 38337511 0.51 38535637 27 204394 38478837 0.53 38683231 28 193828 38453841 0.50 38647669 29 190235 38253771 0.49 38444006 30 196124 38262484 0.51 38458608 31 195397 38320944 0.51 38516341 32 194967 38328202 0.51 38523169 33 197169 38317104 0.51 38514273 34 196985 38357532 0.51 38554517 35 197504 38522447 0.51 38719951 36 191983 38460580 0.50 38652563 37 205204 38398517 0.53 38603721 38 193897 38379202 0.50 38573099 39 191646 38376980 0.50 38568626 40 202755 38239936 0.53 38442691 41 191764 38272592 0.50 38464356 42 193300 38325718 0.50 38519018 43 192833 38250691 0.50 38443524 44 193785 38298967 0.50 38492752 45 196314 38245507 0.51 38441821 46 191387 38240039 0.50 38431426 47 190175 38230019 0.49 38420194 48 196754 38323054 0.51 38519808 49 186768 38256826 0.49 38443594 50 190559 38169345 0.50 38359904 51 192328 38210796 0.50 38403124 52 194788 38203890 0.51 38398678 53 187789 38188202 0.49 38375991 54 193877 38228810 0.50 38422687 55 197949 38116289 0.52 38314238 56 184295 38181861 0.48 38366156 57 190183 38153122 0.50 38343305 58 189878 38244094 0.49 38433972 59 186858 38248709 0.49 38435567 60 193118 38335822 0.50 38528940 61 191746 38287544 0.50 38479290 62 189116 38202699 0.49 38391815 63 189152 38217851 0.49 38407003 64 193871 38191063 0.51 38384934 65 188553 38189975 0.49 38378528 66 191414 38339927 0.50 38531341 67 189730 38355701 0.49 38545431 68 190213 38261228 0.49 38451441 69 191544 38248931 0.50 38440475 70 192418 38141250 0.50 38333668 71 187443 38225327 0.49 38412770 72 189766 38223142 0.49 38412908 73 191631 38144273 0.50 38335904 74 190129 38143786 0.50 38333915 75 190170 38128393 0.50 38318563 76 184782 38131637 0.48 38316419 77 186021 38066628 0.49 38252649 78 192147 37988385 0.50 38180532 79 184216 38005218 0.48 38189434 80 187751 38045116 0.49 38232867 81 187284 37944244 0.49 38131528 82 193132 37932201 0.51 38125333 83 188137 37908580 0.49 38096717 84 190640 37970590 0.50 38161230 85 194800 38065051 0.51 38259851 86 180153 38048795 0.47 38228948 87 186895 38011468 0.49 38198363 88 185854 38039506 0.49 38225360 89 187790 38004232 0.49 38192022 90 189458 38092185 0.49 38281643 91 188137 38096185 0.49 38284322 92 184036 38042702 0.48 38226738 93 187846 38016789 0.49 38204635 94 189057 38084536 0.49 38273593 95 187241 38078667 0.49 38265908 96 186114 38146301 0.49 38332415 97 183998 38105927 0.48 38289925 98 190737 38158995 0.50 38349732 99 182005 38108673 0.48 38290678 100 182583 38035917 0.48 38218500 101 187776 38003576 0.49 38191352 102 193632 38042470 0.51 38236102 103 197950 38017627 0.52 38215577 104 192124 38120201 0.50 38312325 105 179639 37995157 0.47 38174796 106 187332 38040690 0.49 38228022 107 189736 38051050 0.50 38240786 108 186488 38074497 0.49 38260985 109 187080 38060797 0.49 38247877 110 180114 38026986 0.47 38207100 111 186848 37995630 0.49 38182478 112 187136 38017591 0.49 38204727 113 183092 37955489 0.48 38138581 114 186597 37937970 0.49 38124567 115 183628 37964733 0.48 38148361 116 185043 38017869 0.48 38202912 117 180309 37959531 0.47 38139840 118 184443 37983067 0.48 38167510 119 189334 37930941 0.50 38120275 120 190358 37965821 0.50 38156179 121 183367 37976934 0.48 38160301 122 187440 37931517 0.49 38118957 123 186736 37933937 0.49 38120673 124 186273 37943886 0.49 38130159 125 183099 37953734 0.48 38136833 126 185480 37945083 0.49 38130563 127 187693 37918545 0.49 38106238 128 186927 37917445 0.49 38104372 129 188345 37961764 0.49 38150109 130 186873 37946869 0.49 38133742 131 186157 37968841 0.49 38154998 132 188549 37946124 0.49 38134673 133 188978 37929757 0.50 38118735 134 187476 37925767 0.49 38113243 135 188147 37891720 0.49 38079867 136 187770 37877758 0.49 38065528 137 186331 37883893 0.49 38070224 138 186307 37903326 0.49 38089633 139 186022 37934035 0.49 38120057 140 186937 37889082 0.49 38076019 141 185497 37874089 0.49 38059586 142 186889 37851213 0.49 38038102 143 187789 37795202 0.49 37982991 144 187743 37809118 0.49 37996861 145 189560 37777248 0.50 37966808 146 189140 37727164 0.50 37916304 147 188353 37685841 0.50 37874194 148 188766 37569419 0.50 37758185 149 188117 37565258 0.50 37753375 150 288698 37432290 0.77 37720988 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 76343 5051176 1.49 5127519 2 78812 2853008 2.69 2931820 3 863375 1544255 35.86 2407630 4 1471082 1418402 50.91 2889484 5 1744170 1266438 57.93 3010608 6 1791786 1208134 59.73 2999920 7 1908312 1214585 61.11 3122897 8 1755423 1104876 61.37 2860299 9 1903693 1093838 63.51 2997531 10 1841429 1065213 63.35 2906642 11 1813659 1022484 63.95 2836143 12 1815904 998681 64.52 2814585 13 1824959 983350 64.98 2808309 14 1824930 971891 65.25 2796821 15 1853630 974053 65.55 2827683 16 1817248 960015 65.43 2777263 17 1864561 955467 66.12 2820028 18 1823848 938583 66.02 2762431 19 1795695 928096 65.93 2723791 20 1785227 926497 65.83 2711724 21 1802592 923125 66.13 2725717 22 1782040 911253 66.17 2693293 23 1780744 907896 66.23 2688640 24 1774254 901777 66.30 2676031 25 1771174 901361 66.27 2672535 26 1760432 893235 66.34 2653667 27 1721992 883755 66.08 2605747 28 1701622 873229 66.09 2574851 29 1704216 865229 66.33 2569445 30 1693352 858276 66.36 2551628 31 1714214 858041 66.64 2572255 32 1697914 846429 66.73 2544343 33 1707200 840159 67.02 2547359 34 1647229 824197 66.65 2471426 35 1620865 814260 66.56 2435125 36 1630560 814982 66.67 2445542 37 1623487 805571 66.84 2429058 38 1617878 795747 67.03 2413625 39 1648774 794423 67.48 2443197 40 1596272 782520 67.10 2378792 41 1607008 775001 67.46 2382009 42 1570350 764581 67.25 2334931 43 1551839 750121 67.41 2301960 44 1542996 742742 67.51 2285738 45 1538983 739836 67.53 2278819 46 1522901 731940 67.54 2254841 47 1514365 726846 67.57 2241211 48 1481900 710454 67.59 2192354 49 1463763 700746 67.63 2164509 50 1448253 694082 67.60 2142335 51 1427815 684715 67.59 2112530 52 1403885 672243 67.62 2076128 53 1386291 663463 67.63 2049754 54 1362389 652666 67.61 2015055 55 1364352 648016 67.80 2012368 56 1335852 637279 67.70 1973131 57 1320332 629406 67.72 1949738 58 1290146 615257 67.71 1905403 59 1279548 608701 67.76 1888249 60 1252498 599760 67.62 1852258 61 1239458 591613 67.69 1831071 62 1221427 580735 67.78 1802162 63 1208513 571751 67.88 1780264 64 1194080 561965 68.00 1756045 65 1159650 550487 67.81 1710137 66 1133337 541860 67.65 1675197 67 1110199 530743 67.66 1640942 68 1105119 524066 67.83 1629185 69 1090830 514655 67.94 1605485 70 1073643 509238 67.83 1582881 71 1068955 501235 68.08 1570190 72 1036268 490465 67.87 1526733 73 1013346 479107 67.90 1492453 74 992903 469659 67.89 1462562 75 969488 461773 67.74 1431261 76 952829 454487 67.71 1407316 77 940519 446418 67.81 1386937 78 914330 435609 67.73 1349939 79 903626 427198 67.90 1330824 80 876522 419275 67.64 1295797 81 859628 410011 67.71 1269639 82 844890 402440 67.74 1247330 83 831239 395191 67.78 1226430 84 807328 381492 67.91 1188820 85 792747 377191 67.76 1169938 86 772899 369602 67.65 1142501 87 762115 360214 67.90 1122329 88 739952 352164 67.75 1092116 89 727495 344516 67.86 1072011 90 706768 336673 67.73 1043441 91 685451 328805 67.58 1014256 92 672105 321504 67.64 993609 93 655536 312841 67.69 968377 94 641018 305078 67.75 946096 95 632393 300382 67.80 932775 96 611806 292552 67.65 904358 97 595376 284687 67.65 880063 98 577965 277160 67.59 855125 99 563755 271068 67.53 834823 100 551505 264442 67.59 815947 101 537549 258743 67.51 796292 102 525194 251486 67.62 776680 103 512964 244777 67.70 757741 104 496977 238762 67.55 735739 105 481270 232710 67.41 713980 106 472480 227995 67.45 700475 107 462608 221899 67.58 684507 108 450087 214836 67.69 664923 109 435373 208144 67.66 643517 110 424624 204811 67.46 629435 111 414676 199047 67.57 613723 112 402392 194072 67.46 596464 113 387072 187284 67.39 574356 114 376353 182318 67.37 558671 115 369350 178222 67.45 547572 116 357764 173245 67.37 531009 117 348251 167377 67.54 515628 118 339817 162496 67.65 502313 119 331481 157897 67.74 489378 120 320734 154305 67.52 475039 121 311687 150063 67.50 461750 122 303800 146717 67.43 450517 123 296805 141973 67.64 438778 124 285563 136486 67.66 422049 125 278084 133715 67.53 411799 126 270047 130769 67.37 400816 127 267675 126504 67.91 394179 128 258065 122840 67.75 380905 129 250464 118706 67.85 369170 130 243019 115669 67.75 358688 131 235705 112706 67.65 348411 132 227014 109271 67.51 336285 133 221018 106071 67.57 327089 134 214026 103296 67.45 317322 135 209037 100056 67.63 309093 136 200371 96758 67.44 297129 137 192659 93453 67.34 286112 138 185964 90158 67.35 276122 139 181696 88013 67.37 269709 140 175629 85589 67.23 261218 141 169473 82782 67.18 252255 142 163222 79886 67.14 243108 143 159226 77029 67.40 236255 144 153498 74126 67.43 227624 145 147499 72514 67.04 220013 146 141453 70133 66.85 211586 147 136699 68020 66.77 204719 148 131724 65591 66.76 197315 149 127178 63412 66.73 190590 150 122935 61302 66.73 184237 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 152461 10981966 1.37 11134427 2 96845 13705639 0.70 13802484 3 72558 11601891 0.62 11674449 4 60636 9812976 0.61 9873612 5 66089 11142993 0.59 11209082 6 69693 11894412 0.58 11964105 7 66029 11729597 0.56 11795626 8 65587 11494553 0.57 11560140 9 65712 11564334 0.57 11630046 10 64442 11437725 0.56 11502167 11 62259 11190382 0.55 11252641 12 61203 11064969 0.55 11126172 13 60827 10960712 0.55 11021539 14 62145 11121520 0.56 11183665 15 62724 11177960 0.56 11240684 16 61836 11108936 0.55 11170772 17 62492 11137698 0.56 11200190 18 60875 10996278 0.55 11057153 19 60800 10927623 0.55 10988423 20 61307 10967339 0.56 11028646 21 61249 10939125 0.56 11000374 22 59488 10839091 0.55 10898579 23 60313 10826306 0.55 10886619 24 59613 10758667 0.55 10818280 25 59894 10648075 0.56 10707969 26 60666 10853329 0.56 10913995 27 59330 10653568 0.55 10712898 28 59016 10546274 0.56 10605290 29 58095 10488382 0.55 10546477 30 58553 10427905 0.56 10486458 31 58932 10476381 0.56 10535313 32 57945 10333023 0.56 10390968 33 56934 10187221 0.56 10244155 34 56081 10152761 0.55 10208842 35 56021 10032645 0.56 10088666 36 55157 9873616 0.56 9928773 37 54972 9801514 0.56 9856486 38 54489 9676542 0.56 9731031 39 54561 9661312 0.56 9715873 40 53968 9678814 0.55 9732782 41 52320 9462591 0.55 9514911 42 51898 9327405 0.55 9379303 43 51094 9216401 0.55 9267495 44 50938 9160607 0.55 9211545 45 50534 9073380 0.55 9123914 46 50184 9006787 0.55 9056971 47 50013 8942946 0.56 8992959 48 49256 8796521 0.56 8845777 49 48761 8704094 0.56 8752855 50 48322 8651377 0.56 8699699 51 47504 8474296 0.56 8521800 52 47183 8390571 0.56 8437754 53 46626 8272714 0.56 8319340 54 45924 8120171 0.56 8166095 55 46188 8123657 0.57 8169845 56 45153 8009503 0.56 8054656 57 43948 7848473 0.56 7892421 58 44281 7762505 0.57 7806786 59 43462 7643860 0.57 7687322 60 42852 7498526 0.57 7541378 61 41853 7390425 0.56 7432278 62 41556 7263427 0.57 7304983 63 40854 7181470 0.57 7222324 64 40589 7108839 0.57 7149428 65 39834 6977736 0.57 7017570 66 39032 6819544 0.57 6858576 67 37772 6671095 0.56 6708867 68 37402 6549318 0.57 6586720 69 37360 6469042 0.57 6506402 70 36708 6389897 0.57 6426605 71 36124 6300588 0.57 6336712 72 35292 6147867 0.57 6183159 73 34663 6007965 0.57 6042628 74 34684 5914708 0.58 5949392 75 33586 5797750 0.58 5831336 76 33013 5697191 0.58 5730204 77 32696 5582480 0.58 5615176 78 31493 5481514 0.57 5513007 79 31182 5383516 0.58 5414698 80 30591 5287488 0.58 5318079 81 30461 5159159 0.59 5189620 82 29348 5072007 0.58 5101355 83 28762 4948839 0.58 4977601 84 28606 4858776 0.59 4887382 85 27585 4733105 0.58 4760690 86 27179 4623140 0.58 4650319 87 27134 4540681 0.59 4567815 88 25963 4455441 0.58 4481404 89 25251 4354561 0.58 4379812 90 24883 4258136 0.58 4283019 91 24734 4165708 0.59 4190442 92 23578 4053019 0.58 4076597 93 23353 3978799 0.58 4002152 94 22785 3897661 0.58 3920446 95 22275 3805558 0.58 3827833 96 21724 3726314 0.58 3748038 97 21377 3617120 0.59 3638497 98 20607 3529561 0.58 3550168 99 20167 3450025 0.58 3470192 100 19664 3380184 0.58 3399848 101 19211 3291581 0.58 3310792 102 18626 3210136 0.58 3228762 103 18399 3139088 0.58 3157487 104 17524 3054087 0.57 3071611 105 17457 2972259 0.58 2989716 106 17070 2889880 0.59 2906950 107 16343 2816223 0.58 2832566 108 15635 2748643 0.57 2764278 109 15642 2669860 0.58 2685502 110 14945 2593109 0.57 2608054 111 14820 2540282 0.58 2555102 112 14233 2479749 0.57 2493982 113 13953 2411803 0.58 2425756 114 13567 2340261 0.58 2353828 115 13276 2284311 0.58 2297587 116 12544 2212099 0.56 2224643 117 12331 2146363 0.57 2158694 118 12026 2087062 0.57 2099088 119 11540 2031616 0.56 2043156 120 11290 1977790 0.57 1989080 121 11003 1917560 0.57 1928563 122 10641 1860655 0.57 1871296 123 10366 1812246 0.57 1822612 124 10249 1757566 0.58 1767815 125 9864 1703093 0.58 1712957 126 9374 1654235 0.56 1663609 127 9282 1607072 0.57 1616354 128 8723 1558241 0.56 1566964 129 8572 1511070 0.56 1519642 130 8501 1464888 0.58 1473389 131 8004 1427080 0.56 1435084 132 7835 1379964 0.56 1387799 133 7400 1340402 0.55 1347802 134 7424 1298371 0.57 1305795 135 6912 1257069 0.55 1263981 136 6675 1219028 0.54 1225703 137 6663 1181576 0.56 1188239 138 6229 1142391 0.54 1148620 139 6331 1105237 0.57 1111568 140 6012 1072622 0.56 1078634 141 5834 1041482 0.56 1047316 142 5693 1011050 0.56 1016743 143 5281 979286 0.54 984567 144 5306 948512 0.56 953818 145 5044 920227 0.55 925271 146 4823 886405 0.54 891228 147 4881 857012 0.57 861893 148 4456 829842 0.53 834298 149 4489 802681 0.56 807170 150 4301 777134 0.55 781435 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 469400 34933662 1.33 35403062 2 241039 36364038 0.66 36605077 3 233045 37744031 0.61 37977076 4 219931 37724825 0.58 37944756 5 199639 35742449 0.56 35942088 6 191665 35535297 0.54 35726962 7 192484 36373949 0.53 36566433 8 182040 34967323 0.52 35149363 9 184427 35336616 0.52 35521043 10 181894 35256203 0.51 35438097 11 179914 35157111 0.51 35337025 12 180183 34951388 0.51 35131571 13 177207 34668288 0.51 34845495 14 177320 34707286 0.51 34884606 15 176855 34582745 0.51 34759600 16 176737 34647633 0.51 34824370 17 176220 34554915 0.51 34731135 18 174845 34385108 0.51 34559953 19 174271 34307445 0.51 34481716 20 173045 34190969 0.50 34364014 21 172543 34101859 0.50 34274402 22 170359 33987197 0.50 34157556 23 170561 33848766 0.50 34019327 24 168526 33722853 0.50 33891379 25 168316 33525938 0.50 33694254 26 166973 33273280 0.50 33440253 27 165929 33319457 0.50 33485386 28 166352 33111727 0.50 33278079 29 163553 32921924 0.49 33085477 30 162713 32616368 0.50 32779081 31 162902 32506355 0.50 32669257 32 160624 32294333 0.49 32454957 33 160168 32176885 0.50 32337053 34 157751 31762086 0.49 31919837 35 156343 31502701 0.49 31659044 36 156154 31267478 0.50 31423632 37 155164 30987651 0.50 31142815 38 153557 30719583 0.50 30873140 39 151803 30355681 0.50 30507484 40 150073 30092915 0.50 30242988 41 149501 29987920 0.50 30137421 42 146804 29554844 0.49 29701648 43 145443 29239677 0.49 29385120 44 143859 28867551 0.50 29011410 45 142556 28553056 0.50 28695612 46 140873 28296518 0.50 28437391 47 138997 27948490 0.49 28087487 48 137332 27657020 0.49 27794352 49 135482 27332553 0.49 27468035 50 133464 26958312 0.49 27091776 51 131263 26603230 0.49 26734493 52 130343 26308129 0.49 26438472 53 128589 25910500 0.49 26039089 54 126443 25596190 0.49 25722633 55 125335 25273280 0.49 25398615 56 123403 24950536 0.49 25073939 57 122221 24655509 0.49 24777730 58 119758 24261121 0.49 24380879 59 118211 23935911 0.49 24054122 60 116522 23530954 0.49 23647476 61 114189 23148493 0.49 23262682 62 112134 22823565 0.49 22935699 63 110473 22454387 0.49 22564860 64 108932 22113048 0.49 22221980 65 106870 21851150 0.49 21958020 66 105600 21426469 0.49 21532069 67 104136 21105995 0.49 21210131 68 102140 20744390 0.49 20846530 69 100338 20352757 0.49 20453095 70 98274 20063792 0.49 20162066 71 96830 19751199 0.49 19848029 72 95094 19401730 0.49 19496824 73 94262 19085126 0.49 19179388 74 91880 18687882 0.49 18779762 75 90089 18354192 0.49 18444281 76 87947 17994650 0.49 18082597 77 86198 17649514 0.49 17735712 78 84804 17326365 0.49 17411169 79 83544 17026593 0.49 17110137 80 81177 16684345 0.48 16765522 81 80246 16390063 0.49 16470309 82 78283 16015732 0.49 16094015 83 77147 15699180 0.49 15776327 84 75444 15384011 0.49 15459455 85 73344 15026767 0.49 15100111 86 72031 14686954 0.49 14758985 87 70599 14379867 0.49 14450466 88 68964 14084376 0.49 14153340 89 67867 13801217 0.49 13869084 90 65785 13473521 0.49 13539306 91 64510 13140391 0.49 13204901 92 62394 12861160 0.48 12923554 93 61101 12550622 0.48 12611723 94 60174 12294331 0.49 12354505 95 58668 11985239 0.49 12043907 96 57134 11724235 0.48 11781369 97 55675 11457860 0.48 11513535 98 54875 11185901 0.49 11240776 99 53415 10926437 0.49 10979852 100 52269 10673873 0.49 10726142 101 50649 10412773 0.48 10463422 102 48995 10146187 0.48 10195182 103 48506 9916328 0.49 9964834 104 46908 9663638 0.48 9710546 105 45953 9435576 0.48 9481529 106 44604 9193201 0.48 9237805 107 43947 8952791 0.49 8996738 108 42389 8733760 0.48 8776149 109 41764 8511130 0.49 8552894 110 40363 8280117 0.49 8320480 111 39404 8074534 0.49 8113938 112 38428 7874510 0.49 7912938 113 37103 7675717 0.48 7712820 114 36290 7461764 0.48 7498054 115 35638 7257779 0.49 7293417 116 34574 7055450 0.49 7090024 117 33432 6861083 0.48 6894515 118 32277 6668019 0.48 6700296 119 31542 6482520 0.48 6514062 120 30670 6301204 0.48 6331874 121 29966 6127018 0.49 6156984 122 29070 5949125 0.49 5978195 123 28355 5773497 0.49 5801852 124 27591 5608619 0.49 5636210 125 26646 5448659 0.49 5475305 126 25918 5273681 0.49 5299599 127 25239 5124004 0.49 5149243 128 24161 4971610 0.48 4995771 129 23505 4821442 0.49 4844947 130 22890 4682664 0.49 4705554 131 22197 4537197 0.49 4559394 132 21798 4403206 0.49 4425004 133 21013 4271989 0.49 4293002 134 20209 4140327 0.49 4160536 135 19454 4007568 0.48 4027022 136 19248 3878320 0.49 3897568 137 18511 3764621 0.49 3783132 138 17549 3648693 0.48 3666242 139 17135 3530591 0.48 3547726 140 16704 3421402 0.49 3438106 141 16294 3311754 0.49 3328048 142 15909 3212991 0.49 3228900 143 15180 3113556 0.49 3128736 144 14735 3014798 0.49 3029533 145 14286 2919657 0.49 2933943 146 13911 2822825 0.49 2836736 147 13519 2728557 0.49 2742076 148 13076 2639922 0.49 2652998 149 12443 2556568 0.48 2569011 150 12032 2475643 0.48 2487675