CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1780826 939832 65.46 2720658 2 1397001 684720 67.11 2081721 3 1719114 924648 65.03 2643762 4 1793889 986047 64.53 2779936 5 1829649 979287 65.14 2808936 6 1872150 999349 65.20 2871499 7 1747587 926896 65.34 2674483 8 1837453 957311 65.75 2794764 9 1790292 950469 65.32 2740761 10 1760580 945086 65.07 2705666 11 1723843 933666 64.87 2657509 12 1755989 946584 64.97 2702573 13 1761024 940582 65.18 2701606 14 1760268 956167 64.80 2716435 15 1758072 943222 65.08 2701294 16 1795708 965004 65.05 2760712 17 1770786 946750 65.16 2717536 18 1751530 945286 64.95 2696816 19 1742592 951146 64.69 2693738 20 1781241 953993 65.12 2735234 21 1778933 951135 65.16 2730068 22 1777076 955783 65.03 2732859 23 1786271 957958 65.09 2744229 24 1767134 970539 64.55 2737673 25 1790579 964040 65.00 2754619 26 1740693 975225 64.09 2715918 27 1741345 968493 64.26 2709838 28 1775263 960072 64.90 2735335 29 1763708 965172 64.63 2728880 30 1810779 972205 65.07 2782984 31 1786510 973891 64.72 2760401 32 1823172 970359 65.26 2793531 33 1756158 971053 64.39 2727211 34 1734773 962502 64.32 2697275 35 1767752 967952 64.62 2735704 36 1784005 968435 64.82 2752440 37 1785891 967919 64.85 2753810 38 1822137 973748 65.17 2795885 39 1780032 972639 64.67 2752671 40 1802246 974536 64.90 2776782 41 1786182 964995 64.92 2751177 42 1767705 964089 64.71 2731794 43 1794889 967622 64.97 2762511 44 1811189 973497 65.04 2784686 45 1814833 976657 65.01 2791490 46 1782798 974074 64.67 2756872 47 1790665 965541 64.97 2756206 48 1786687 980266 64.57 2766953 49 1806677 976986 64.90 2783663 50 1799906 968735 65.01 2768641 51 1792850 966013 64.99 2758863 52 1802433 965984 65.11 2768417 53 1806254 970927 65.04 2777181 54 1838059 984779 65.11 2822838 55 1801717 978525 64.80 2780242 56 1810572 974421 65.01 2784993 57 1805934 967296 65.12 2773230 58 1804300 973422 64.96 2777722 59 1817096 974432 65.09 2791528 60 1829472 973450 65.27 2802922 61 1817120 974388 65.09 2791508 62 1841821 976137 65.36 2817958 63 1826331 970481 65.30 2796812 64 1819297 976660 65.07 2795957 65 1810872 971794 65.08 2782666 66 1805174 966484 65.13 2771658 67 1809691 967219 65.17 2776910 68 1827797 975673 65.20 2803470 69 1828673 974483 65.24 2803156 70 1841488 974972 65.38 2816460 71 1824037 970248 65.28 2794285 72 1824586 972730 65.23 2797316 73 1818935 969681 65.23 2788616 74 1819485 970639 65.21 2790124 75 1822246 979274 65.04 2801520 76 1826017 969951 65.31 2795968 77 1818252 968840 65.24 2787092 78 1820475 974761 65.13 2795236 79 1814696 971592 65.13 2786288 80 1831925 972294 65.33 2804219 81 1814125 974364 65.06 2788489 82 1821681 973227 65.18 2794908 83 1829947 969327 65.37 2799274 84 1825286 979030 65.09 2804316 85 1821683 977550 65.08 2799233 86 1818824 971271 65.19 2790095 87 1832955 971517 65.36 2804472 88 1837441 976925 65.29 2814366 89 1840579 975303 65.36 2815882 90 1837207 974924 65.33 2812131 91 1825812 974473 65.20 2800285 92 1847569 971915 65.53 2819484 93 1850800 971201 65.58 2822001 94 1863122 983556 65.45 2846678 95 1852367 974757 65.52 2827124 96 1840306 974992 65.37 2815298 97 1844891 973833 65.45 2818724 98 1834636 978697 65.21 2813333 99 1857705 986291 65.32 2843996 100 1850300 980659 65.36 2830959 101 1853912 978664 65.45 2832576 102 1850453 975470 65.48 2825923 103 1846880 976280 65.42 2823160 104 1840038 983835 65.16 2823873 105 1854374 992244 65.14 2846618 106 1856376 974402 65.58 2830778 107 1854593 978686 65.46 2833279 108 1852139 975048 65.51 2827187 109 1834626 980421 65.17 2815047 110 1812318 973656 65.05 2785974 111 1847756 977039 65.41 2824795 112 1840164 973762 65.39 2813926 113 1817971 973091 65.14 2791062 114 1849387 980082 65.36 2829469 115 1844493 978740 65.33 2823233 116 1848681 978917 65.38 2827598 117 1857823 988289 65.28 2846112 118 1855534 981093 65.41 2836627 119 1840815 979042 65.28 2819857 120 1839317 979026 65.26 2818343 121 1825394 977071 65.14 2802465 122 1851420 976541 65.47 2827961 123 1846556 980708 65.31 2827264 124 1841244 983039 65.19 2824283 125 1850968 988080 65.20 2839048 126 1859315 983141 65.41 2842456 127 1868992 984413 65.50 2853405 128 1860950 984687 65.40 2845637 129 1866089 989275 65.35 2855364 130 1851607 985134 65.27 2836741 131 1857796 985863 65.33 2843659 132 1861166 983916 65.42 2845082 133 1860912 983829 65.42 2844741 134 1871018 990588 65.38 2861606 135 1861630 989543 65.29 2851173 136 1847586 989264 65.13 2836850 137 1844367 988892 65.10 2833259 138 1848883 989172 65.15 2838055 139 1856349 997079 65.06 2853428 140 1849932 997857 64.96 2847789 141 1832797 993691 64.84 2826488 142 1850990 995129 65.04 2846119 143 1839563 996918 64.85 2836481 144 1842737 1001850 64.78 2844587 145 1833534 1003447 64.63 2836981 146 1830493 1005386 64.55 2835879 147 1826847 1008507 64.43 2835354 148 1819241 1007446 64.36 2826687 149 1783321 1014246 63.75 2797567 150 1834335 1019128 64.28 2853463 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 169562 10970681 1.52 11140243 2 79978 9428715 0.84 9508693 3 79362 11023380 0.71 11102742 4 73303 11709165 0.62 11782468 5 67361 11814319 0.57 11881680 6 66210 11584834 0.57 11651044 7 65846 11619494 0.56 11685340 8 66027 11540345 0.57 11606372 9 64053 11351705 0.56 11415758 10 65266 11321257 0.57 11386523 11 61167 11293008 0.54 11354175 12 64122 11450006 0.56 11514128 13 64301 11539167 0.55 11603468 14 62918 11449539 0.55 11512457 15 64253 11576761 0.55 11641014 16 63170 11498856 0.55 11562026 17 60879 11476651 0.53 11537530 18 64222 11573939 0.55 11638161 19 63734 11630442 0.55 11694176 20 63002 11574994 0.54 11637996 21 61939 11597089 0.53 11659028 22 63788 11626733 0.55 11690521 23 64558 11605043 0.55 11669601 24 66701 11837811 0.56 11904512 25 63784 11682016 0.54 11745800 26 64804 11591395 0.56 11656199 27 67248 11646393 0.57 11713641 28 63783 11763532 0.54 11827315 29 63672 11826399 0.54 11890071 30 63810 11734806 0.54 11798616 31 63750 11703017 0.54 11766767 32 64250 11744172 0.54 11808422 33 65811 11770094 0.56 11835905 34 65165 11697545 0.55 11762710 35 64651 11719709 0.55 11784360 36 62705 11680598 0.53 11743303 37 68210 11829854 0.57 11898064 38 64294 11837346 0.54 11901640 39 62324 11754405 0.53 11816729 40 66277 11718815 0.56 11785092 41 63358 11665324 0.54 11728682 42 63111 11749726 0.53 11812837 43 64538 11814218 0.54 11878756 44 63961 11762315 0.54 11826276 45 64946 11813403 0.55 11878349 46 63084 11747142 0.53 11810226 47 63229 11788021 0.53 11851250 48 65440 11828481 0.55 11893921 49 61878 11782640 0.52 11844518 50 63062 11768651 0.53 11831713 51 63023 11702265 0.54 11765288 52 63908 11686418 0.54 11750326 53 62636 11786678 0.53 11849314 54 64408 11784395 0.54 11848803 55 65279 11773282 0.55 11838561 56 61330 11747849 0.52 11809179 57 62835 11751911 0.53 11814746 58 62811 11736276 0.53 11799087 59 61815 11727697 0.52 11789512 60 63751 11734936 0.54 11798687 61 63626 11785822 0.54 11849448 62 63317 11842706 0.53 11906023 63 62216 11796346 0.52 11858562 64 64411 11751230 0.55 11815641 65 62489 11698833 0.53 11761322 66 63693 11732331 0.54 11796024 67 62823 11791565 0.53 11854388 68 63110 11820069 0.53 11883179 69 63343 11809271 0.53 11872614 70 64132 11735950 0.54 11800082 71 62237 11724638 0.53 11786875 72 63291 11778956 0.53 11842247 73 64126 11760888 0.54 11825014 74 63500 11756386 0.54 11819886 75 63775 11762930 0.54 11826705 76 61716 11795480 0.52 11857196 77 62157 11792346 0.52 11854503 78 64821 11824651 0.55 11889472 79 61733 11766601 0.52 11828334 80 62998 11817718 0.53 11880716 81 62162 11779401 0.52 11841563 82 64896 11806274 0.55 11871170 83 62611 11776590 0.53 11839201 84 63499 11780167 0.54 11843666 85 65138 11829642 0.55 11894780 86 60458 11839065 0.51 11899523 87 62749 11834842 0.53 11897591 88 62682 11816980 0.53 11879662 89 62485 11804848 0.53 11867333 90 63620 11776792 0.54 11840412 91 63480 11826057 0.53 11889537 92 61503 11809438 0.52 11870941 93 62924 11809981 0.53 11872905 94 63734 11778281 0.54 11842015 95 62733 11785539 0.53 11848272 96 62291 11793828 0.53 11856119 97 61578 11782592 0.52 11844170 98 63274 11796095 0.53 11859369 99 60454 11796170 0.51 11856624 100 61152 11795188 0.52 11856340 101 62950 11832403 0.53 11895353 102 64782 11812168 0.55 11876950 103 65265 11783351 0.55 11848616 104 64246 11803334 0.54 11867580 105 60625 11808232 0.51 11868857 106 62274 11810919 0.52 11873193 107 63351 11797834 0.53 11861185 108 61956 11811648 0.52 11873604 109 62245 11861980 0.52 11924225 110 60785 11852273 0.51 11913058 111 62766 11819158 0.53 11881924 112 62722 11831626 0.53 11894348 113 61944 11871798 0.52 11933742 114 62288 11834379 0.52 11896667 115 61432 11812223 0.52 11873655 116 62072 11823425 0.52 11885497 117 60829 11834718 0.51 11895547 118 62070 11825927 0.52 11887997 119 64143 11814050 0.54 11878193 120 63667 11813342 0.54 11877009 121 61458 11842976 0.52 11904434 122 62717 11821495 0.53 11884212 123 62400 11801939 0.53 11864339 124 62362 11818606 0.52 11880968 125 61491 11839817 0.52 11901308 126 62425 11809531 0.53 11871956 127 63658 11809866 0.54 11873524 128 62094 11814615 0.52 11876709 129 63663 11816256 0.54 11879919 130 61942 11811138 0.52 11873080 131 62257 11805903 0.52 11868160 132 63034 11833573 0.53 11896607 133 63326 11849582 0.53 11912908 134 62749 11861912 0.53 11924661 135 63555 11817221 0.53 11880776 136 62755 11787929 0.53 11850684 137 62765 11789806 0.53 11852571 138 62244 11803292 0.52 11865536 139 62935 11807461 0.53 11870396 140 62833 11826608 0.53 11889441 141 61968 11834687 0.52 11896655 142 62897 11825835 0.53 11888732 143 62886 11811501 0.53 11874387 144 63363 11791243 0.53 11854606 145 63596 11791886 0.54 11855482 146 63503 11780628 0.54 11844131 147 64029 11776019 0.54 11840048 148 63420 11768539 0.54 11831959 149 63746 11778939 0.54 11842685 150 94577 11743818 0.80 11838395 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 516385 37334524 1.36 37850909 2 267582 33508074 0.79 33775656 3 265959 38451317 0.69 38717276 4 243012 40097914 0.60 40340926 5 215502 39541587 0.54 39757089 6 214124 39893154 0.53 40107278 7 209387 39194887 0.53 39404274 8 212283 39377237 0.54 39589520 9 207542 39027609 0.53 39235151 10 212582 39065211 0.54 39277793 11 198786 39043952 0.51 39242738 12 208697 39227058 0.53 39435755 13 206092 39184272 0.52 39390364 14 204871 39410956 0.52 39615827 15 205748 39402878 0.52 39608626 16 202802 39464480 0.51 39667282 17 197099 39571892 0.50 39768991 18 206546 39822741 0.52 40029287 19 203452 39740164 0.51 39943616 20 201942 39529701 0.51 39731643 21 198283 39539295 0.50 39737578 22 203124 39767702 0.51 39970826 23 206181 39751835 0.52 39958016 24 208945 39634993 0.52 39843938 25 202913 39603171 0.51 39806084 26 205887 39661269 0.52 39867156 27 214059 39779505 0.54 39993564 28 201465 39759916 0.50 39961381 29 197641 39553532 0.50 39751173 30 202479 39580345 0.51 39782824 31 202845 39628175 0.51 39831020 32 201999 39642001 0.51 39844000 33 205187 39653483 0.51 39858670 34 205128 39684332 0.51 39889460 35 205487 39827890 0.51 40033377 36 198087 39770206 0.50 39968293 37 214058 39692382 0.54 39906440 38 200115 39670694 0.50 39870809 39 198088 39668118 0.50 39866206 40 208849 39541933 0.53 39750782 41 198128 39580790 0.50 39778918 42 198979 39646591 0.50 39845570 43 199873 39555189 0.50 39755062 44 200590 39582677 0.50 39783267 45 202998 39533465 0.51 39736463 46 198064 39504382 0.50 39702446 47 196681 39508049 0.50 39704730 48 203729 39591959 0.51 39795688 49 192441 39541364 0.48 39733805 50 196561 39447573 0.50 39644134 51 198841 39503476 0.50 39702317 52 201428 39462525 0.51 39663953 53 193776 39463187 0.49 39656963 54 200132 39490587 0.50 39690719 55 204262 39376560 0.52 39580822 56 191651 39435644 0.48 39627295 57 195990 39422221 0.49 39618211 58 196932 39484506 0.50 39681438 59 193412 39475219 0.49 39668631 60 199148 39565318 0.50 39764466 61 196878 39499304 0.50 39696182 62 194580 39434065 0.49 39628645 63 193938 39443986 0.49 39637924 64 200358 39415479 0.51 39615837 65 193822 39410017 0.49 39603839 66 197942 39548425 0.50 39746367 67 194736 39530009 0.49 39724745 68 196813 39452155 0.50 39648968 69 196936 39446943 0.50 39643879 70 199033 39328822 0.50 39527855 71 194244 39423138 0.49 39617382 72 195994 39415057 0.49 39611051 73 198007 39343681 0.50 39541688 74 196962 39347670 0.50 39544632 75 196703 39324428 0.50 39521131 76 190286 39322488 0.48 39512774 77 191895 39266277 0.49 39458172 78 198703 39189306 0.50 39388009 79 187884 39204504 0.48 39392388 80 193393 39241804 0.49 39435197 81 193697 39153137 0.49 39346834 82 199090 39141323 0.51 39340413 83 193427 39113853 0.49 39307280 84 196776 39175175 0.50 39371951 85 201097 39243673 0.51 39444770 86 185780 39244631 0.47 39430411 87 193523 39210910 0.49 39404433 88 192396 39231419 0.49 39423815 89 193864 39190398 0.49 39384262 90 195523 39252186 0.50 39447709 91 193725 39255079 0.49 39448804 92 190281 39220135 0.48 39410416 93 193544 39197546 0.49 39391090 94 196054 39258566 0.50 39454620 95 192384 39251636 0.49 39444020 96 191559 39290960 0.49 39482519 97 189118 39259412 0.48 39448530 98 194624 39316515 0.49 39511139 99 186388 39237020 0.47 39423408 100 187832 39186758 0.48 39374590 101 193214 39160206 0.49 39353420 102 200054 39176710 0.51 39376764 103 203398 39168640 0.52 39372038 104 199050 39252029 0.50 39451079 105 185352 39142580 0.47 39327932 106 193073 39178716 0.49 39371789 107 194362 39187350 0.49 39381712 108 190919 39188388 0.48 39379307 109 192179 39185046 0.49 39377225 110 185699 39150607 0.47 39336306 111 193015 39134497 0.49 39327512 112 192030 39154607 0.49 39346637 113 188713 39104011 0.48 39292724 114 191806 39083294 0.49 39275100 115 189303 39104285 0.48 39293588 116 190736 39152879 0.48 39343615 117 185913 39122525 0.47 39308438 118 188329 39123649 0.48 39311978 119 194922 39088919 0.50 39283841 120 195601 39095414 0.50 39291015 121 188945 39117861 0.48 39306806 122 192805 39073669 0.49 39266474 123 190900 39091676 0.49 39282576 124 191762 39089772 0.49 39281534 125 187812 39083381 0.48 39271193 126 191588 39081062 0.49 39272650 127 193870 39048351 0.49 39242221 128 192061 39042850 0.49 39234911 129 193452 39077066 0.49 39270518 130 191721 39074439 0.49 39266160 131 192353 39090002 0.49 39282355 132 192911 39067269 0.49 39260180 133 194292 39060830 0.49 39255122 134 193055 39048070 0.49 39241125 135 193495 39043873 0.49 39237368 136 192655 39017768 0.49 39210423 137 191592 39019159 0.49 39210751 138 192306 39035980 0.49 39228286 139 192845 39053025 0.49 39245870 140 192152 39025910 0.49 39218062 141 190892 39004069 0.49 39194961 142 193155 38976637 0.49 39169792 143 192442 38948770 0.49 39141212 144 193765 38932170 0.50 39125935 145 195023 38916249 0.50 39111272 146 194294 38891915 0.50 39086209 147 194395 38852689 0.50 39047084 148 193422 38757129 0.50 38950551 149 193832 38717146 0.50 38910978 150 283777 38602732 0.73 38886509 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 73896 4987809 1.46 5061705 2 67801 2799115 2.36 2866916 3 765831 1524510 33.44 2290341 4 1316082 1482222 47.03 2798304 5 1577086 1359658 53.70 2936744 6 1627533 1302608 55.54 2930141 7 1733688 1306296 57.03 3039984 8 1593900 1181827 57.42 2775727 9 1751720 1163435 60.09 2915155 10 1697311 1124014 60.16 2821325 11 1678827 1078180 60.89 2757007 12 1681169 1048079 61.60 2729248 13 1690277 1030426 62.13 2720703 14 1691145 1019937 62.38 2711082 15 1727087 1025484 62.74 2752571 16 1688887 1008892 62.60 2697779 17 1738248 1000088 63.48 2738336 18 1703728 986808 63.32 2690536 19 1677755 970646 63.35 2648401 20 1665527 976358 63.04 2641885 21 1685075 972900 63.40 2657975 22 1665914 963226 63.36 2629140 23 1666410 957076 63.52 2623486 24 1658024 951513 63.54 2609537 25 1662544 951879 63.59 2614423 26 1657738 945939 63.67 2603677 27 1617672 937133 63.32 2554805 28 1598834 925295 63.34 2524129 29 1609170 918724 63.66 2527894 30 1597170 910970 63.68 2508140 31 1623622 910255 64.08 2533877 32 1612129 899781 64.18 2511910 33 1620500 896334 64.39 2516834 34 1566204 878441 64.07 2444645 35 1546818 868096 64.05 2414914 36 1557708 868861 64.19 2426569 37 1550857 860453 64.32 2411310 38 1550985 848857 64.63 2399842 39 1586430 847442 65.18 2433872 40 1535562 834513 64.79 2370075 41 1547540 830197 65.08 2377737 42 1516390 817265 64.98 2333655 43 1499925 806100 65.04 2306025 44 1492506 796093 65.21 2288599 45 1490401 792567 65.28 2282968 46 1476418 788605 65.18 2265023 47 1477748 782222 65.39 2259970 48 1443234 763711 65.40 2206945 49 1426592 757841 65.31 2184433 50 1417112 754036 65.27 2171148 51 1400211 740498 65.41 2140709 52 1379771 731676 65.35 2111447 53 1358867 718883 65.40 2077750 54 1343809 709141 65.46 2052950 55 1349229 707315 65.61 2056544 56 1319453 697095 65.43 2016548 57 1308914 688542 65.53 1997456 58 1280542 675148 65.48 1955690 59 1273030 669063 65.55 1942093 60 1247397 662226 65.32 1909623 61 1236648 654237 65.40 1890885 62 1225487 644582 65.53 1870069 63 1217618 635178 65.72 1852796 64 1200930 625363 65.76 1826293 65 1170788 615611 65.54 1786399 66 1146757 608264 65.34 1755021 67 1127660 596210 65.41 1723870 68 1123782 588822 65.62 1712604 69 1109383 580256 65.66 1689639 70 1094365 576042 65.51 1670407 71 1092150 567828 65.79 1659978 72 1060122 555624 65.61 1615746 73 1041997 546382 65.60 1588379 74 1022831 536010 65.61 1558841 75 999012 527809 65.43 1526821 76 988956 523042 65.41 1511998 77 973200 513265 65.47 1486465 78 952503 499748 65.59 1452251 79 942108 493032 65.65 1435140 80 919879 484820 65.49 1404699 81 899246 476187 65.38 1375433 82 888027 468968 65.44 1356995 83 876551 460054 65.58 1336605 84 855221 448745 65.59 1303966 85 840061 444547 65.39 1284608 86 819202 435762 65.28 1254964 87 811486 426134 65.57 1237620 88 788795 415154 65.52 1203949 89 777635 408527 65.56 1186162 90 758481 401743 65.37 1160224 91 737723 392697 65.26 1130420 92 723872 384317 65.32 1108189 93 707095 376501 65.25 1083596 94 693385 367966 65.33 1061351 95 686377 362721 65.43 1049098 96 665706 355150 65.21 1020856 97 647295 345369 65.21 992664 98 632695 337475 65.21 970170 99 617057 330548 65.12 947605 100 604930 324490 65.09 929420 101 591133 317700 65.04 908833 102 579983 309729 65.19 889712 103 569112 303230 65.24 872342 104 552696 295033 65.20 847729 105 537685 288950 65.05 826635 106 527794 283152 65.08 810946 107 515188 275168 65.18 790356 108 503831 268781 65.21 772612 109 487443 262296 65.02 749739 110 477485 256061 65.09 733546 111 467220 250298 65.12 717518 112 455329 245404 64.98 700733 113 440263 236872 65.02 677135 114 429094 230771 65.03 659865 115 421472 226887 65.01 648359 116 408232 220558 64.92 628790 117 398218 215105 64.93 613323 118 389844 209177 65.08 599021 119 381336 204285 65.12 585621 120 368629 199130 64.93 567759 121 361274 195577 64.88 556851 122 352417 189101 65.08 541518 123 344306 183705 65.21 528011 124 333134 178511 65.11 511645 125 325674 175710 64.96 501384 126 317801 171060 65.01 488861 127 315302 166838 65.40 482140 128 305304 162209 65.30 467513 129 296199 156515 65.43 452714 130 288527 153850 65.22 442377 131 281523 149914 65.25 431437 132 273527 145861 65.22 419388 133 265791 140780 65.37 406571 134 256554 137545 65.10 394099 135 250223 134544 65.03 384767 136 242179 130127 65.05 372306 137 232479 125384 64.96 357863 138 226106 121206 65.10 347312 139 219865 118311 65.01 338176 140 213288 115184 64.93 328472 141 206010 112534 64.67 318544 142 200542 109159 64.75 309701 143 194106 105837 64.71 299943 144 188153 101888 64.87 290041 145 182507 100220 64.55 282727 146 175262 96466 64.50 271728 147 169620 93975 64.35 263595 148 164535 90720 64.46 255255 149 158290 88183 64.22 246473 150 153436 85568 64.20 239004 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 148943 10956454 1.34 11105397 2 99357 13884279 0.71 13983636 3 73287 11734042 0.62 11807329 4 58577 9651252 0.60 9709829 5 65844 11151320 0.59 11217164 6 68515 11932062 0.57 12000577 7 66571 11777694 0.56 11844265 8 64840 11505485 0.56 11570325 9 65326 11568399 0.56 11633725 10 63921 11470502 0.55 11534423 11 61690 11214217 0.55 11275907 12 60997 11093116 0.55 11154113 13 60774 10993982 0.55 11054756 14 61822 11180181 0.55 11242003 15 61765 11197252 0.55 11259017 16 61114 11141273 0.55 11202387 17 62005 11167353 0.55 11229358 18 61212 11043350 0.55 11104562 19 60402 10994571 0.55 11054973 20 60542 11035019 0.55 11095561 21 60958 10994165 0.55 11055123 22 60112 10928547 0.55 10988659 23 60154 10921786 0.55 10981940 24 60010 10849174 0.55 10909184 25 59759 10748752 0.55 10808511 26 61167 10959861 0.56 11021028 27 59616 10780929 0.55 10840545 28 59634 10671054 0.56 10730688 29 58222 10616269 0.55 10674491 30 58754 10572899 0.55 10631653 31 58879 10630247 0.55 10689126 32 57886 10501840 0.55 10559726 33 57534 10371870 0.55 10429404 34 56802 10345844 0.55 10402646 35 56559 10244353 0.55 10300912 36 55730 10095127 0.55 10150857 37 55801 10037854 0.55 10093655 38 54823 9923474 0.55 9978297 39 54904 9915357 0.55 9970261 40 55571 9945621 0.56 10001192 41 53584 9753270 0.55 9806854 42 53147 9636221 0.55 9689368 43 51917 9539368 0.54 9591285 44 52278 9480282 0.55 9532560 45 51800 9411139 0.55 9462939 46 52015 9358832 0.55 9410847 47 50965 9306963 0.54 9357928 48 51139 9188079 0.55 9239218 49 50464 9102302 0.55 9152766 50 50179 9053949 0.55 9104128 51 49369 8882862 0.55 8932231 52 49016 8823722 0.55 8872738 53 47699 8706656 0.54 8754355 54 47830 8564108 0.56 8611938 55 47812 8583493 0.55 8631305 56 46931 8487491 0.55 8534422 57 46892 8329695 0.56 8376587 58 46331 8253158 0.56 8299489 59 45177 8141006 0.55 8186183 60 45123 8011553 0.56 8056676 61 44458 7907923 0.56 7952381 62 43681 7790096 0.56 7833777 63 43414 7722430 0.56 7765844 64 43203 7659284 0.56 7702487 65 41917 7538016 0.55 7579933 66 41323 7378715 0.56 7420038 67 40712 7241935 0.56 7282647 68 40308 7133528 0.56 7173836 69 40394 7061395 0.57 7101789 70 39760 6987346 0.57 7027106 71 39395 6902037 0.57 6941432 72 38513 6751834 0.57 6790347 73 37977 6622032 0.57 6660009 74 37500 6526768 0.57 6564268 75 36421 6407088 0.57 6443509 76 36343 6313174 0.57 6349517 77 35300 6211387 0.57 6246687 78 34748 6095443 0.57 6130191 79 34481 6015427 0.57 6049908 80 33879 5922740 0.57 5956619 81 33390 5785528 0.57 5818918 82 32872 5704173 0.57 5737045 83 31933 5586931 0.57 5618864 84 31571 5489706 0.57 5521277 85 30886 5361390 0.57 5392276 86 30090 5260747 0.57 5290837 87 29481 5172318 0.57 5201799 88 29432 5093969 0.57 5123401 89 28642 4985637 0.57 5014279 90 28390 4893896 0.58 4922286 91 27542 4796454 0.57 4823996 92 26432 4680652 0.56 4707084 93 26349 4601803 0.57 4628152 94 26068 4519685 0.57 4545753 95 25573 4430742 0.57 4456315 96 24989 4338335 0.57 4363324 97 24335 4229768 0.57 4254103 98 24131 4143066 0.58 4167197 99 23177 4061150 0.57 4084327 100 23022 3977855 0.58 4000877 101 22341 3888281 0.57 3910622 102 21972 3797982 0.58 3819954 103 21378 3717670 0.57 3739048 104 20714 3636356 0.57 3657070 105 20487 3545705 0.57 3566192 106 19968 3458461 0.57 3478429 107 19048 3377912 0.56 3396960 108 19071 3306440 0.57 3325511 109 18208 3222199 0.56 3240407 110 17759 3140250 0.56 3158009 111 17434 3085437 0.56 3102871 112 17253 3014013 0.57 3031266 113 16777 2942343 0.57 2959120 114 16242 2860588 0.56 2876830 115 15942 2798803 0.57 2814745 116 15250 2717717 0.56 2732967 117 15115 2646319 0.57 2661434 118 14803 2581584 0.57 2596387 119 14298 2518676 0.56 2532974 120 14012 2456735 0.57 2470747 121 13528 2388773 0.56 2402301 122 12988 2326381 0.56 2339369 123 12811 2268995 0.56 2281806 124 12281 2204950 0.55 2217231 125 12010 2144509 0.56 2156519 126 11573 2091034 0.55 2102607 127 11365 2033390 0.56 2044755 128 10912 1975772 0.55 1986684 129 10668 1925747 0.55 1936415 130 10356 1869342 0.55 1879698 131 10175 1822770 0.56 1832945 132 9906 1773576 0.56 1783482 133 9591 1721859 0.55 1731450 134 9091 1672828 0.54 1681919 135 8841 1624313 0.54 1633154 136 8653 1579525 0.54 1588178 137 8500 1536278 0.55 1544778 138 8084 1488896 0.54 1496980 139 7840 1444369 0.54 1452209 140 7706 1405412 0.55 1413118 141 7393 1368753 0.54 1376146 142 7229 1328297 0.54 1335526 143 7084 1290885 0.55 1297969 144 6843 1253989 0.54 1260832 145 6621 1215308 0.54 1221929 146 6360 1177683 0.54 1184043 147 6157 1142092 0.54 1148249 148 6088 1105394 0.55 1111482 149 5853 1075143 0.54 1080996 150 5653 1044283 0.54 1049936 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 477164 36216121 1.30 36693285 2 252994 37746044 0.67 37999038 3 243737 38983177 0.62 39226914 4 230607 39066897 0.59 39297504 5 209332 36978176 0.56 37187508 6 199553 36736034 0.54 36935587 7 200894 37653998 0.53 37854892 8 190004 36116599 0.52 36306603 9 191886 36541289 0.52 36733175 10 190672 36547623 0.52 36738295 11 188847 36479038 0.52 36667885 12 188008 36281797 0.52 36469805 13 185823 36064510 0.51 36250333 14 185615 36098361 0.51 36283976 15 185639 36028866 0.51 36214505 16 184944 36111966 0.51 36296910 17 184379 36038238 0.51 36222617 18 182672 35885158 0.51 36067830 19 182277 35851066 0.51 36033343 20 181325 35750003 0.50 35931328 21 181275 35685614 0.51 35866889 22 179377 35574118 0.50 35753495 23 177651 35482477 0.50 35660128 24 176738 35392602 0.50 35569340 25 177714 35192281 0.50 35369995 26 175395 34963880 0.50 35139275 27 174414 35050532 0.50 35224946 28 175020 34854325 0.50 35029345 29 173580 34696885 0.50 34870465 30 172313 34436888 0.50 34609201 31 171917 34325416 0.50 34497333 32 171458 34154598 0.50 34326056 33 170715 34054719 0.50 34225434 34 168147 33687257 0.50 33855404 35 167128 33450837 0.50 33617965 36 166468 33264001 0.50 33430469 37 164905 33017719 0.50 33182624 38 163845 32769516 0.50 32933361 39 162601 32443534 0.50 32606135 40 161275 32219298 0.50 32380573 41 160596 32120144 0.50 32280740 42 158289 31741462 0.50 31899751 43 156253 31449243 0.49 31605496 44 154204 31096894 0.49 31251098 45 153614 30821847 0.50 30975461 46 152676 30585158 0.50 30737834 47 150745 30277513 0.50 30428258 48 148573 29998758 0.49 30147331 49 147565 29726408 0.49 29873973 50 145480 29384656 0.49 29530136 51 143652 29046263 0.49 29189915 52 142912 28789394 0.49 28932306 53 140556 28420180 0.49 28560736 54 139461 28128347 0.49 28267808 55 138107 27835811 0.49 27973918 56 136242 27540689 0.49 27676931 57 135339 27247313 0.49 27382652 58 133165 26858930 0.49 26992095 59 131434 26578419 0.49 26709853 60 130556 26189151 0.50 26319707 61 128061 25829450 0.49 25957511 62 125517 25526397 0.49 25651914 63 124098 25162786 0.49 25286884 64 122824 24833998 0.49 24956822 65 121552 24591889 0.49 24713441 66 119526 24179632 0.49 24299158 67 117545 23859546 0.49 23977091 68 116133 23491690 0.49 23607823 69 113849 23118380 0.49 23232229 70 112851 22841766 0.49 22954617 71 110167 22525773 0.49 22635940 72 109063 22195340 0.49 22304403 73 107506 21870859 0.49 21978365 74 105526 21480237 0.49 21585763 75 104006 21150800 0.49 21254806 76 101868 20776018 0.49 20877886 77 100279 20427581 0.49 20527860 78 99266 20098170 0.49 20197436 79 96549 19798157 0.49 19894706 80 94993 19445998 0.49 19540991 81 93590 19141261 0.49 19234851 82 91836 18756759 0.49 18848595 83 90841 18433893 0.49 18524734 84 88327 18110549 0.49 18198876 85 86976 17737870 0.49 17824846 86 85264 17375782 0.49 17461046 87 83289 17057054 0.49 17140343 88 82378 16753702 0.49 16836080 89 80905 16454968 0.49 16535873 90 79007 16097114 0.49 16176121 91 77088 15756759 0.49 15833847 92 75117 15469210 0.48 15544327 93 73807 15129876 0.49 15203683 94 72761 14855716 0.49 14928477 95 70914 14530527 0.49 14601441 96 69361 14238758 0.48 14308119 97 67932 13956780 0.48 14024712 98 66491 13650628 0.48 13717119 99 64986 13374035 0.48 13439021 100 64272 13107591 0.49 13171863 101 62965 12820154 0.49 12883119 102 61748 12529119 0.49 12590867 103 59587 12268373 0.48 12327960 104 58669 11984985 0.49 12043654 105 57340 11731221 0.49 11788561 106 55911 11460279 0.49 11516190 107 54506 11194544 0.48 11249050 108 52887 10946500 0.48 10999387 109 52447 10687518 0.49 10739965 110 50845 10435036 0.48 10485881 111 49431 10192661 0.48 10242092 112 48358 9971158 0.48 10019516 113 47600 9739838 0.49 9787438 114 46311 9494126 0.49 9540437 115 44950 9264414 0.48 9309364 116 43869 9027070 0.48 9070939 117 42957 8797515 0.49 8840472 118 41955 8575507 0.49 8617462 119 40791 8362045 0.49 8402836 120 39669 8144696 0.48 8184365 121 39036 7944826 0.49 7983862 122 37626 7729444 0.48 7767070 123 36447 7531744 0.48 7568191 124 35913 7333313 0.49 7369226 125 35183 7137665 0.49 7172848 126 34486 6927164 0.50 6961650 127 32825 6750490 0.48 6783315 128 32473 6560332 0.49 6592805 129 31145 6379554 0.49 6410699 130 30295 6214036 0.49 6244331 131 29362 6039408 0.48 6068770 132 29004 5872471 0.49 5901475 133 27670 5710269 0.48 5737939 134 27264 5553313 0.49 5580577 135 26628 5391342 0.49 5417970 136 25752 5234253 0.49 5260005 137 24766 5086156 0.48 5110922 138 24298 4944998 0.49 4969296 139 23675 4794940 0.49 4818615 140 22878 4655724 0.49 4678602 141 22071 4521291 0.49 4543362 142 21546 4397058 0.49 4418604 143 21116 4272139 0.49 4293255 144 20104 4146656 0.48 4166760 145 19693 4022755 0.49 4042448 146 18984 3901492 0.48 3920476 147 18605 3777363 0.49 3795968 148 17848 3666751 0.48 3684599 149 17462 3562186 0.49 3579648 150 16972 3458660 0.49 3475632